51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21420 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21420  predicted protein  100 
 
 
743 aa  1541    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03628  N-terminal acetyltransferase catalytic subunit (NAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11910)  36.41 
 
 
833 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108078  normal  0.314019 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48350  predicted protein  31.75 
 
 
882 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.156647  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04270  conserved hypothetical protein  30.35 
 
 
870 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73563  predicted protein  29.13 
 
 
782 aa  231  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560069  normal  0.314839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.91 
 
 
927 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
605 aa  55.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
371 aa  54.7  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
265 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 
265 aa  52.4  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 
632 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.88 
 
 
436 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
409 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
543 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 
1694 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
366 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
4079 aa  49.3  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 
1979 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  21.76 
 
 
397 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 
279 aa  48.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
534 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
1297 aa  47.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.36 
 
 
576 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
522 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  21.79 
 
 
1252 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
280 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 
1240 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
1127 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 
1276 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 
374 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.71 
 
 
557 aa  45.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
1737 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 
512 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.75 
 
 
1138 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 
988 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 
343 aa  45.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
416 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 
162 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
441 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.45 
 
 
441 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.64 
 
 
784 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 
818 aa  44.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1590  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.63 
 
 
294 aa  44.3  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
761 aa  44.3  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
804 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 
538 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.49 
 
 
784 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.92 
 
 
1056 aa  44.3  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
800 aa  44.3  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
602 aa  43.9  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  21.05 
 
 
581 aa  43.9  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>