34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_17954 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_17954  predicted protein  100 
 
 		 158 aa  323  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13807  predicted protein  49.07 
 
 		 165 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0443254  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05400  initiation factor 5a (eif-5a), putative  45.81 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.470767  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78463  Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF-5A) (eIF-4D)  42.76 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04015  eukaryotic translation initiation factor 5A-2 (Broad)  42.38 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0003  translation initiation factor eIF-5A  33.33 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1756  translation initiation factor IF-5A  38.68 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.455468  normal  0.26313 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1571  translation initiation factor IF-5A  40 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0434  translation initiation factor IF-5A  38 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0904  translation initiation factor IF-5A  43.37 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0110821  normal  0.486202 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1751  translation initiation factor IF-5A  44.05 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000442771  hitchhiker  0.00446575 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0409  translation initiation factor IF-5A  35.65 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0581  translation initiation factor IF-5A  40.48 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1350  translation initiation factor eIF-5A  41.05 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0722695  normal  0.0450814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0895  translation initiation factor IF-5A  32.58 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2337  translation initiation factor eIF-5A  44.58 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0426  translation initiation factor 5A (eIF-5A)  40.96 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.609574 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1949  translation initiation factor eIF-5A  36.84 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0966  translation initiation factor eIF-5A  38.3 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0915  translation initiation factor IF-5A  33.05 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1703  translation initiation factor IF-5A  36.63 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0199  translation initiation factor IF-5A  33.66 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0529  translation initiation factor eIF-5A  31.97 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0237  translation initiation factor IF-5A  32.67 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676894  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0759  translation initiation factor IF-5A  32.67 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.824142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3103  translation initiation factor eIF-5A  32.63 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0695  translation initiation factor IF-5A  33.33 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.612946  normal  0.300408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1897  translation initiation factor IF-5A  34.38 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1207  translation initiation factor eIF-5A  30.53 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1604  translation initiation factor eIF-5A  32.53 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2581  translation initiation factor IF-5A  31.33 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.257819  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1578  translation initiation factor IF-5A  28.71 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.238981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1686  translation initiation factor IF-5A  33.33 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.230293  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04695  Woronin body major protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P8K9]  24.83 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000213252  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>