88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15852 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_15852  predicted protein  100 
 
 		 138 aa  274  4e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0113934  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01490  copper zinc superoxide dismutase  49.28 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00241  Superoxide dismutase [Cu-Zn] (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9HEY7]  46.76 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28559  predicted protein  44.44 
 
 		 197 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000859292  hitchhiker  0.000000574282 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89018  Superoxide dismutase (Cu-Zn)  43.48 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.204777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  40.8 
 
 		 184 aa  88.6  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  40.15 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3449  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.61 
 
 		 180 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  41.96 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  36.07 
 
 		 172 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  35.71 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  36.8 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.87 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32550  copper/zinc superoxide dismutase-like protein  32.9 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  37.6 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  34.53 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.23 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  33.82 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.04 
 
 		 212 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  34.68 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.06 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.06 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  29.85 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.81 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.36 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.31 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.2 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.04 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4523  superoxide dismutase  30.37 
 
 		 510 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.94 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.09 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.06 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.62 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  31.75 
 
 		 194 aa  48.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  32.14 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  29.41 
 
 		 203 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.92 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1062  copper/zinc superoxide dismutase  32.33 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.7887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1214  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.33 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1056  copper/zinc superoxide dismutase  32.33 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  29.23 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0859  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.33 
 
 		 216 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.35 
 
 		 239 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  30.15 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  31.75 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1613  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0712489  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  34.23 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2300  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2986  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228777  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0713  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  27.97 
 
 		 180 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.54 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  33.33 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.42 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.16 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0860  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.58 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0340028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  26.62 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1507  superoxide dismutase precursor (Cu-Zn)  25.5 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.814898  normal  0.841266 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  31.75 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2481  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  29.6 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5765  copper/Zinc superoxide dismutase  30.89 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212202  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2347  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4059  superoxide dismutase copper/zinc binding  28.85 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.453641  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  31.5 
 
 		 200 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06045  superoxide dismutase copper chaperone Lys7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09700)  31.73 
 
 		 247 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.621456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.47 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.91 
 
 		 191 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  33.88 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2434  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.89 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  27.27 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  27.94 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2439  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.89 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1823  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.89 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  27.97 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1018  superoxide dismutase copper/zinc binding  30.08 
 
 		 177 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0356333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0122  superoxide dismutase (Cu/Zn)  28.57 
 
 		 179 aa  40  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.291157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3479  putative copper/zinc superoxide dismutase  30.08 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2653  superoxide dismutase, copper/zinc binding  30.07 
 
 		 182 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  31.54 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  32.28 
 
 		 180 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>