48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0517 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  100 
 
 		 960 aa  1986    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  27.37 
 
 		 969 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  27.37 
 
 		 969 aa  323  9.999999999999999e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  25.51 
 
 		 951 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  25.6 
 
 		 968 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  26.33 
 
 		 919 aa  267  8e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  26.22 
 
 		 909 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  23.66 
 
 		 911 aa  242  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1039 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1000 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.53 
 
 		 984 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.42 
 
 		 997 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1100 aa  99  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  21.53 
 
 		 786 aa  68.2  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  21.92 
 
 		 780 aa  65.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  21.64 
 
 		 781 aa  62  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  21.96 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  20.97 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.6 
 
 		 1049 aa  59.7  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  29.47 
 
 		 299 aa  57  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22.76 
 
 		 994 aa  55.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1151 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.61 
 
 		 803 aa  55.1  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.98 
 
 		 916 aa  54.7  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  30.86 
 
 		 297 aa  54.7  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  19.22 
 
 		 957 aa  53.5  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  21.35 
 
 		 781 aa  52.4  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.74 
 
 		 989 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  18.9 
 
 		 976 aa  51.6  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.67 
 
 		 836 aa  50.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  22 
 
 		 957 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1100 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  19.87 
 
 		 906 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  28.21 
 
 		 304 aa  49.3  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  22.88 
 
 		 988 aa  48.5  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  20.77 
 
 		 788 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1079 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  20.81 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2040  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.82 
 
 		 1146 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0003  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.09 
 
 		 1099 aa  46.6  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  23.79 
 
 		 913 aa  46.2  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  25.7 
 
 		 1077 aa  46.2  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  20.06 
 
 		 991 aa  46.2  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  20.73 
 
 		 788 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 302 aa  45.8  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1775  ATP-dependent nuclease subunit B  26.56 
 
 		 1149 aa  45.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.64 
 
 		 940 aa  45.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  25.35 
 
 		 267 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>