More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2392 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  64.4 
 
 
578 aa  761    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  100 
 
 
580 aa  1184    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  98.79 
 
 
580 aa  1173    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  67.03 
 
 
546 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  76.92 
 
 
575 aa  899    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  61.24 
 
 
582 aa  714    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  61.64 
 
 
550 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  60.76 
 
 
578 aa  676    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  44.55 
 
 
592 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  46.97 
 
 
556 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  43.27 
 
 
552 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  42.96 
 
 
581 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09401  ABC transporter  39.51 
 
 
580 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  41.35 
 
 
548 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  41.68 
 
 
578 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  41.43 
 
 
578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  40.43 
 
 
568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  41.19 
 
 
548 aa  442  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  41 
 
 
547 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  42.81 
 
 
598 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  42.71 
 
 
601 aa  432  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
598 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.1 
 
 
572 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.75 
 
 
585 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.71 
 
 
577 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  40.21 
 
 
598 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  40.1 
 
 
575 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
575 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39 
 
 
580 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.58 
 
 
614 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.62 
 
 
582 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.52 
 
 
580 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.63 
 
 
617 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.54 
 
 
608 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  39.16 
 
 
597 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  38.77 
 
 
589 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 
571 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.99 
 
 
601 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
613 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  39.96 
 
 
612 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.5 
 
 
587 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  39.51 
 
 
588 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
585 aa  379  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  37.99 
 
 
597 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.3 
 
 
579 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.72 
 
 
606 aa  375  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  35.31 
 
 
597 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.54 
 
 
600 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.31 
 
 
587 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  39.9 
 
 
600 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  41.04 
 
 
576 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  41.8 
 
 
641 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
578 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  38.51 
 
 
571 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.33 
 
 
602 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
626 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.46 
 
 
596 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  38.52 
 
 
639 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  40.91 
 
 
594 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  39.65 
 
 
586 aa  364  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.74 
 
 
611 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  41.41 
 
 
602 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.39 
 
 
609 aa  362  9e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.2 
 
 
583 aa  362  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.02 
 
 
571 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.62 
 
 
625 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.02 
 
 
571 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.02 
 
 
571 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.02 
 
 
571 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.67 
 
 
592 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.74 
 
 
579 aa  360  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  34.38 
 
 
582 aa  360  4e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  40.55 
 
 
601 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  36.8 
 
 
603 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
571 aa  360  5e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  36.46 
 
 
603 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
571 aa  359  7e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0351  hypothetical protein  40.91 
 
 
611 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.378963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  37.92 
 
 
613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.52 
 
 
583 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  36.98 
 
 
644 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.84 
 
 
571 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  34.84 
 
 
571 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
571 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.74 
 
 
613 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  39.06 
 
 
588 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.33 
 
 
588 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  35.48 
 
 
617 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.16 
 
 
586 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  41.1 
 
 
642 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.99 
 
 
618 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.8 
 
 
602 aa  355  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  35.85 
 
 
627 aa  354  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  37.02 
 
 
601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  38.24 
 
 
610 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.04 
 
 
579 aa  353  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  37 
 
 
607 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  38.65 
 
 
589 aa  353  7e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  34.78 
 
 
581 aa  353  7e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>