More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0713 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  99.19 
 
 		 124 aa  248  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  57.48 
 
 		 176 aa  151  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  47.2 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  48.78 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  54.84 
 
 		 108 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  54.35 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  55.79 
 
 		 108 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  53.93 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  50.48 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  47.5 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  53.93 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  56.04 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  49.45 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  49.45 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  48.35 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  49.44 
 
 		 172 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  49.45 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  38.68 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  37.74 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  36.27 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  34.44 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 125 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2462  SSU ribosomal protein S6P  35.16 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3419  ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.797124  normal  0.172954 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1212  30S ribosomal protein S6  36.63 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134172  normal  0.709191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  33.71 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  33.06 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  32.71 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3260  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012398  hitchhiker  0.0000109167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0687  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000703568  hitchhiker  0.000317476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  36.84 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0701  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000757321  hitchhiker  0.000144082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0415  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  36.36 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3930  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  33 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  32.22 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1900  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2503  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000597267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0753  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000769486  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0741  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000275832  hitchhiker  0.000127866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0732  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00282194  hitchhiker  0.0000000108888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0711  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.165791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 122 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  32.29 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0923  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3643  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0657  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1714  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1935  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0753505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1416  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  30 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03778  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>