More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4284 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 224 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 224 aa  254  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  55.16 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 		 224 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  54.3 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 224 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.39 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 223 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.89 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.89 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.89 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.91 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.91 
 
 		 225 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  50.89 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.94 
 
 		 225 aa  228  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 226 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 224 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 224 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  52.25 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.68 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 222 aa  224  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  51.12 
 
 		 225 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.58 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  51.35 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  50.45 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  49.77 
 
 		 223 aa  221  7e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 		 226 aa  221  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.02 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.16 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 241 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0702  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.32 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.149482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  52 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.78 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  48.2 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.67 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.23 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  48.2 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  48.18 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4389  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6111  regulator protein CopR  51.11 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110686  normal  0.158568 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  214  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 231 aa  213  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.19 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2490  heavy metal response regulator  51.75 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1742  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.595604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.35 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  49.32 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>