More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0001 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  68.25 
 
 
456 aa  652  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
453 aa  936  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  70.68 
 
 
460 aa  652  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  75 
 
 
453 aa  711  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  75.22 
 
 
453 aa  712  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  69.52 
 
 
460 aa  659  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  65.73 
 
 
482 aa  628  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  53.3 
 
 
454 aa  506  1e-142  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  53.3 
 
 
466 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  55.36 
 
 
462 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  53.68 
 
 
464 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  55.51 
 
 
463 aa  493  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  53.28 
 
 
464 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  52.97 
 
 
464 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  54.89 
 
 
450 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  52.2 
 
 
463 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  52.09 
 
 
464 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.58 
 
 
453 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  47.26 
 
 
446 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.58 
 
 
463 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  46.67 
 
 
450 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  46.62 
 
 
446 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  46.4 
 
 
450 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.45 
 
 
446 aa  415  1e-115  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  47.17 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  47.17 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  46.35 
 
 
446 aa  417  1e-115  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  46.04 
 
 
457 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  45.61 
 
 
457 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.86 
 
 
454 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  46.45 
 
 
446 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.1 
 
 
446 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.2 
 
 
443 aa  407  1e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.32 
 
 
449 aa  406  1e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  48.52 
 
 
442 aa  400  1e-110  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  48.41 
 
 
441 aa  399  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.75 
 
 
444 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  46.77 
 
 
440 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  46.49 
 
 
443 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  44.79 
 
 
451 aa  391  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  44.04 
 
 
480 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  45 
 
 
436 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  44.23 
 
 
472 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.95 
 
 
439 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.19 
 
 
439 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  43.68 
 
 
453 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  43.68 
 
 
453 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  42.68 
 
 
481 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  46.94 
 
 
445 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.2 
 
 
461 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.7 
 
 
447 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  45.13 
 
 
443 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.24 
 
 
458 aa  365  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.17 
 
 
587 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.2 
 
 
456 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.17 
 
 
591 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  42.43 
 
 
478 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.49 
 
 
480 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.45 
 
 
453 aa  360  3e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.83 
 
 
509 aa  356  4e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  41.32 
 
 
445 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 
495 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 
495 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  42.38 
 
 
495 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  44.15 
 
 
470 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.66 
 
 
721 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.14 
 
 
528 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.72 
 
 
566 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  40.7 
 
 
492 aa  347  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.51 
 
 
450 aa  346  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.86 
 
 
450 aa  346  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  50.3 
 
 
494 aa  345  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  51.88 
 
 
597 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.78732e-07  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  53.49 
 
 
582 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.67 
 
 
527 aa  343  3e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.8 
 
 
454 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  39.02 
 
 
449 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.47 
 
 
562 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  6.90317e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.07 
 
 
570 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.74 
 
 
480 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.06 
 
 
652 aa  340  3e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.33 
 
 
527 aa  339  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 
464 aa  337  3e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  52.2 
 
 
577 aa  336  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  53.03 
 
 
615 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.18 
 
 
462 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.12 
 
 
447 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.93 
 
 
515 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  43.61 
 
 
440 aa  331  1e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.38 
 
 
506 aa  331  1e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.33 
 
 
534 aa  332  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.58 
 
 
476 aa  331  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.40109e-09  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  39.87 
 
 
463 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.17775e-05  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  39.69 
 
 
465 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.97 
 
 
452 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.62 
 
 
503 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>