61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3430 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  100 
 
 		 237 aa  483  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  88.19 
 
 		 237 aa  424  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  47.93 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  49.59 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  47.11 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  43.36 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  43.36 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  39.81 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  39.81 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  39.81 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  39.34 
 
 		 212 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  39.81 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  39.81 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  40.29 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  37.61 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  41.15 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  41.15 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  41.15 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  40.67 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  40.67 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  39.51 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  37.01 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  37.72 
 
 		 198 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  31.62 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  43.42 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  56.25 
 
 		 59 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  25.64 
 
 		 441 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.47 
 
 		 473 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  29.13 
 
 		 472 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  30.09 
 
 		 503 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  25.78 
 
 		 475 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  30.91 
 
 		 468 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  25 
 
 		 459 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  23.03 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  22.3 
 
 		 439 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  32.53 
 
 		 475 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  30.61 
 
 		 447 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  32.53 
 
 		 473 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  24.69 
 
 		 439 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  24.69 
 
 		 439 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  24.69 
 
 		 439 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  23.72 
 
 		 424 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  24.69 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  23.46 
 
 		 439 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  24.69 
 
 		 431 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  25.74 
 
 		 462 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  24.68 
 
 		 428 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  23.17 
 
 		 423 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  24.07 
 
 		 439 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  27.17 
 
 		 438 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  24.53 
 
 		 418 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  37.93 
 
 		 512 aa  41.6  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>