41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0779 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  100 
 
 
234 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  51.24 
 
 
237 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  54.69 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  49.17 
 
 
237 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  45.6 
 
 
246 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  44.77 
 
 
224 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  45.6 
 
 
246 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  41.09 
 
 
212 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  41.09 
 
 
212 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  41.09 
 
 
212 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  40.59 
 
 
212 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  41.29 
 
 
210 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  41.09 
 
 
212 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  41.09 
 
 
212 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  41.09 
 
 
212 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  42.79 
 
 
211 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  42.79 
 
 
211 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  42.79 
 
 
211 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  42.29 
 
 
211 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  42.29 
 
 
211 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  40.7 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  43.54 
 
 
216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  35.06 
 
 
198 aa  82  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  41.57 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  42.17 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  40.79 
 
 
402 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  54.17 
 
 
59 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  28.72 
 
 
459 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  27.33 
 
 
418 aa  45.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  23.57 
 
 
419 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  23.26 
 
 
439 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  29.89 
 
 
503 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  26.32 
 
 
441 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  25 
 
 
446 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  24.34 
 
 
423 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  24.68 
 
 
418 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  27.91 
 
 
447 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  23.53 
 
 
470 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.31 
 
 
468 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  24.66 
 
 
424 aa  42  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  25.74 
 
 
434 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>