38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0451 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  100 
 
 
224 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  55.69 
 
 
246 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  55.69 
 
 
246 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  46.25 
 
 
237 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  53.17 
 
 
216 aa  184  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  44.81 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  44.77 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  38.74 
 
 
239 aa  141  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  37.74 
 
 
212 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  37.74 
 
 
212 aa  136  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  37.74 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  37.26 
 
 
212 aa  134  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  38.21 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  38.21 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  38.21 
 
 
212 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  34.8 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  39.13 
 
 
209 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  39.51 
 
 
211 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  39.51 
 
 
211 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  39.02 
 
 
211 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  39.02 
 
 
211 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  39.02 
 
 
211 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  35.04 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  63.27 
 
 
59 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  31.82 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  36.36 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  25.66 
 
 
423 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  32.04 
 
 
402 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  25.17 
 
 
439 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  26.28 
 
 
468 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  25.34 
 
 
418 aa  45.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  26.83 
 
 
472 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  24.2 
 
 
431 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  26.67 
 
 
459 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  26.35 
 
 
490 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  24.49 
 
 
428 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  23.78 
 
 
424 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  25.36 
 
 
447 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>