45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4683 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  84.43 
 
 		 212 aa  358  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  84.43 
 
 		 212 aa  358  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  83.96 
 
 		 212 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  83.96 
 
 		 212 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  83.96 
 
 		 212 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  83.96 
 
 		 212 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  83.96 
 
 		 212 aa  343  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  81.04 
 
 		 211 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  81.04 
 
 		 211 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  80.57 
 
 		 211 aa  320  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  80.57 
 
 		 211 aa  320  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  80.57 
 
 		 211 aa  320  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  69.95 
 
 		 210 aa  284  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  40.1 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  43.75 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  43.75 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  39.13 
 
 		 224 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  40.1 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  40.29 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  40.5 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  40.12 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  34.38 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  36.27 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  36.47 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  56.25 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  35.37 
 
 		 402 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  28.71 
 
 		 439 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  25.86 
 
 		 475 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  25.61 
 
 		 468 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  25.52 
 
 		 441 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  25.13 
 
 		 470 aa  46.2  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  26.67 
 
 		 468 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  24.55 
 
 		 468 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  26.06 
 
 		 468 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  26.06 
 
 		 468 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  25 
 
 		 419 aa  41.2  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>