35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3634 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  97.07 
 
 		 216 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  55.69 
 
 		 224 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  44.44 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  46 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  43.36 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  41.41 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  43.6 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  43.6 
 
 		 212 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  43.6 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  43.13 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  41.21 
 
 		 210 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  45.15 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  45.15 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  45.15 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  43.13 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  43.13 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  43.13 
 
 		 212 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  45.15 
 
 		 211 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  45.15 
 
 		 211 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  43.75 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  98 
 
 		 59 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  33.76 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  39.36 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  41.67 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  39.18 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  29.33 
 
 		 441 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  28.47 
 
 		 447 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  25.34 
 
 		 439 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  22.44 
 
 		 423 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  29.25 
 
 		 468 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  24.39 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  24.52 
 
 		 424 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  24 
 
 		 418 aa  43.1  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>