More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1416 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02942  putrescine:2-oxoglutaric acid aminotransferase, PLP-dependent  74.51 
 
 		 468 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0628  putrescine aminotransferase  77.49 
 
 		 429 aa  688    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1819  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  95.81 
 
 		 477 aa  948    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3479  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  74.94 
 
 		 459 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3540  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  77.73 
 
 		 429 aa  690    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1416  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  100 
 
 		 477 aa  985    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1304  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  80.13 
 
 		 472 aa  765    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000448411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3513  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  75.17 
 
 		 459 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000252781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2699  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  82.02 
 
 		 472 aa  783    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3255  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  77.49 
 
 		 429 aa  689    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3409  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  74.94 
 
 		 459 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3528  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  73.89 
 
 		 459 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.31743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3405  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  74.94 
 
 		 459 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3575  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  74.94 
 
 		 459 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.328531 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0627  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  77.73 
 
 		 429 aa  690    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4387  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  76.55 
 
 		 459 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3367  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  78.28 
 
 		 429 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02892  hypothetical protein  76.32 
 
 		 459 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1277  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  59.38 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0468315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2006  putrescine--2-oxoglutarate aminotransferase  47.37 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0819  aminotransferase class-III  45.13 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.149442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2220  aminotransferase class-III  47.72 
 
 		 411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17220  ornithine aminotransferase  41.28 
 
 		 462 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1419  aminotransferase class-III  43.79 
 
 		 460 aa  329  7e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2058  aminotransferase class-III  43.84 
 
 		 475 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0166657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1580  aminotransferase class-III  46.44 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.118025  normal  0.128058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0106  aminotransferase  42.11 
 
 		 460 aa  312  7.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0539911  hitchhiker  0.0000000000015302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1785  aminotransferase  44.02 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1194  aminotransferase class-III  45.14 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.120122  normal  0.0636258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0653  aminotransferase class-III  42.82 
 
 		 467 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0978357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2083  ornithine/acetylornithine aminotransferase  39.32 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.128445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5127  aminotransferase class-III  44.48 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1291  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.64 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0338748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  40.91 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  38.88 
 
 		 891 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.89 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  38.71 
 
 		 396 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5761  aminotransferase class-III  38.08 
 
 		 438 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  41.54 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  40.59 
 
 		 398 aa  264  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0321  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.21 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  39.19 
 
 		 385 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  38.93 
 
 		 385 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.26 
 
 		 397 aa  259  9e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  38.59 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  38.77 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.85 
 
 		 427 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  40.89 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  40.35 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4056  Acetylornithine transaminase  39.57 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  42.12 
 
 		 403 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  38.32 
 
 		 408 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  39.85 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1416  acetylornithine aminotransferase  40.68 
 
 		 415 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0956406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  38.33 
 
 		 418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  40.48 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  41.95 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  39.5 
 
 		 955 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  40.48 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1070  aminotransferase class-III  35.34 
 
 		 460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.96 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.79 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2722  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 389 aa  253  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.601213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  41.42 
 
 		 391 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  40.49 
 
 		 427 aa  252  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  42.42 
 
 		 845 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  38.77 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  40.22 
 
 		 406 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  38.89 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3076  Acetylornithine transaminase  40.21 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25771  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0348  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.05 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0949  aminotransferase class-III  37.47 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  38.79 
 
 		 399 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  38.26 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.48 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  38.48 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  37.14 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  38.46 
 
 		 396 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3460  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.33 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640133 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  38.71 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0433  aminotransferase class-III  42.7 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2888  acetylornithine aminotransferase  41.58 
 
 		 397 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0887768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.05 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  38.22 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  38.22 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  39.62 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  37.14 
 
 		 680 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  36.97 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1636  aminotransferase class-III  40.94 
 
 		 403 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  38.12 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  39.47 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  38.42 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38.82 
 
 		 399 aa  243  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  37.3 
 
 		 396 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>