More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63370 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  94.84 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  42.86 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  42.86 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  39.57 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  41.73 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1809  glycine cleavage H-protein  32.79 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0431801  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  31.72 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  36.8 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  34.75 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  34.75 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  37.61 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  37.27 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  39.17 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  38.68 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  38.68 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  33.85 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  40.74 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  34.29 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  35.45 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  36.7 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  29.17 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  27.94 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  32.82 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  36.45 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  33.87 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  31.86 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  32.43 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  32.03 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  39.25 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  31.4 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  39.13 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  39.13 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0152  glycine cleavage system H protein  37.89 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  36.7 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  33.08 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  36.7 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  33.08 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  33.08 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  32.71 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  38.32 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  33.05 
 
 		 233 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  34.91 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  33.59 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  30.95 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  35.9 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  30.71 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  31.86 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  36.11 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  34.26 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  35.85 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  34.86 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  33.03 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  31.86 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  29.84 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  32.74 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  38.32 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1097  glycine cleavage system protein H  37.96 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  27.59 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  37.93 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  29.91 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  34.38 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  38.32 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  35.92 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  29.51 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  30.36 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5032  glycine cleavage system protein H  31.9 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  30.16 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  31.97 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  32.73 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  31.86 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  34.58 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  33.04 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  32.43 
 
 		 126 aa  67  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  30.84 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>