More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35190 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_35190  penicillin-binding protein 3A  100 
 
 
565 aa  1153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2968  penicillin-binding protein 3A  98.76 
 
 
565 aa  1141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  49.54 
 
 
579 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  48.82 
 
 
583 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  49.18 
 
 
576 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  48.57 
 
 
578 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  48.66 
 
 
579 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  48.48 
 
 
579 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  48.45 
 
 
580 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  48.63 
 
 
575 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  48.16 
 
 
582 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  48.16 
 
 
582 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  48.45 
 
 
575 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  45.85 
 
 
570 aa  477  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  41.76 
 
 
622 aa  461  1e-128  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  41.76 
 
 
613 aa  455  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  41.76 
 
 
613 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  44.53 
 
 
583 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.65 
 
 
553 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  41.88 
 
 
587 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.28115e-11 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.29 
 
 
553 aa  447  1e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  43.82 
 
 
548 aa  446  1e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  43.82 
 
 
552 aa  446  1e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.03 
 
 
570 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 
614 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  39.05 
 
 
568 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.34 
 
 
571 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  39.19 
 
 
580 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  41.97 
 
 
582 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 
588 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  41.45 
 
 
570 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  40.26 
 
 
586 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  40.6 
 
 
607 aa  422  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  39.82 
 
 
577 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  41.43 
 
 
624 aa  417  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.34 
 
 
619 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.49 
 
 
595 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0815  peptidoglycan synthetase FtsI  39.28 
 
 
581 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265307  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  39.67 
 
 
595 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  40.95 
 
 
615 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2985  peptidoglycan synthetase FtsI  39.57 
 
 
600 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  40.27 
 
 
605 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  40.69 
 
 
578 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  41.86 
 
 
615 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 
615 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 
615 aa  408  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  41.13 
 
 
615 aa  407  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 
615 aa  408  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 
575 aa  407  1e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 
578 aa  406  1e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  39.16 
 
 
597 aa  405  1e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 
616 aa  406  1e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
588 aa  407  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
588 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.06 
 
 
621 aa  407  1e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
588 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
588 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  41.38 
 
 
588 aa  406  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90417e-08 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.74 
 
 
588 aa  409  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 
595 aa  408  1e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  41.35 
 
 
614 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 
580 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
614 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  40.88 
 
 
621 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  40 
 
 
575 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  39.53 
 
 
601 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  41.06 
 
 
614 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  41.2 
 
 
587 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
614 aa  401  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
614 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
614 aa  401  1e-110  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4564  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 
580 aa  401  1e-110  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  38.8 
 
 
580 aa  399  1e-110  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
614 aa  401  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
614 aa  401  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  38.32 
 
 
578 aa  400  1e-110  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  41.17 
 
 
614 aa  401  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  37.77 
 
 
578 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.11 
 
 
587 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  41.67 
 
 
588 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  39.38 
 
 
587 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  39.38 
 
 
587 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.93 
 
 
587 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 
582 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  37.77 
 
 
578 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.06404e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  37.23 
 
 
582 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  38.22 
 
 
578 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 
587 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  37.99 
 
 
582 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  37.13 
 
 
610 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  37.57 
 
 
577 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  37.39 
 
 
582 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>