More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_05681 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  71 
 
 
464 aa  658    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
454 aa  940    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  76.62 
 
 
466 aa  706    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  69.26 
 
 
463 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  72.96 
 
 
462 aa  668    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0973  chromosomal replication initiation protein  70.93 
 
 
450 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  70.74 
 
 
464 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06211  chromosomal replication initiation protein  69.91 
 
 
464 aa  650    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.62128  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  76.51 
 
 
464 aa  705    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  74.3 
 
 
463 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  57.99 
 
 
482 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  55.85 
 
 
460 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  53.98 
 
 
460 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  54.88 
 
 
456 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  53.3 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  54.02 
 
 
453 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  53.79 
 
 
453 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  46.67 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  46.21 
 
 
446 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.67 
 
 
446 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.19 
 
 
446 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.19 
 
 
453 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  46.19 
 
 
446 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  46.64 
 
 
446 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  44.99 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  44.87 
 
 
450 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  44.84 
 
 
450 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.62 
 
 
454 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
457 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
457 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  42.25 
 
 
451 aa  385  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  44.14 
 
 
440 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.83 
 
 
446 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.15 
 
 
463 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.47 
 
 
443 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  43.76 
 
 
441 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 
453 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  41.96 
 
 
453 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.71 
 
 
449 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.57 
 
 
439 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  44.74 
 
 
470 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  42 
 
 
481 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  41.6 
 
 
480 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  42.92 
 
 
436 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  43.12 
 
 
442 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.24 
 
 
439 aa  359  5e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  40.95 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.58 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.09 
 
 
456 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.36 
 
 
454 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.17 
 
 
447 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.18 
 
 
458 aa  353  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  41.31 
 
 
472 aa  352  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  41.61 
 
 
460 aa  348  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.3 
 
 
591 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.6 
 
 
587 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  41.58 
 
 
458 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  42.73 
 
 
445 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.72 
 
 
449 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.21 
 
 
478 aa  348  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.46 
 
 
453 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
443 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.7 
 
 
461 aa  346  6e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 
450 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.91 
 
 
445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  50.58 
 
 
597 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.55 
 
 
509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  45.45 
 
 
495 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  45.45 
 
 
495 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  45.45 
 
 
495 aa  336  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  52.03 
 
 
577 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  48.4 
 
 
494 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.58 
 
 
566 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  45.04 
 
 
492 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.34 
 
 
447 aa  333  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.45 
 
 
476 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.86 
 
 
570 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  39.74 
 
 
440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.45 
 
 
480 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  40.93 
 
 
452 aa  329  8e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.83 
 
 
506 aa  327  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.13 
 
 
450 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.88 
 
 
721 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.15 
 
 
528 aa  322  6e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.45 
 
 
503 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.71 
 
 
527 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.94 
 
 
489 aa  320  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  50.72 
 
 
582 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  40.27 
 
 
450 aa  318  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.56 
 
 
518 aa  317  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
477 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.2 
 
 
490 aa  316  4e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428353  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.59 
 
 
562 aa  316  5e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  50 
 
 
615 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>