More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4551 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4551  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1733  translation initiation factor IF-3  43.78 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.128322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  44.09 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  42.78 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  44.38 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  43.9 
 
 		 198 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 173 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.12 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  41.32 
 
 		 173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  42.01 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  41.5 
 
 		 357 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  42.94 
 
 		 401 aa  145  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 173 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 173 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 356 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  41.62 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  43.56 
 
 		 396 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 171 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  41.88 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 178 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  43.29 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  44.08 
 
 		 154 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 173 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  41.92 
 
 		 169 aa  141  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  40 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  43.75 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  41.25 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  40.68 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  37.13 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  44.17 
 
 		 179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  43.54 
 
 		 204 aa  138  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  40.52 
 
 		 173 aa  138  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  44.44 
 
 		 173 aa  138  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  42.68 
 
 		 198 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 227 aa  137  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  42.59 
 
 		 329 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  45.77 
 
 		 146 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 169 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  40.12 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  41.36 
 
 		 175 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  38.27 
 
 		 171 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  41.72 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1314  translation initiation factor IF-3  40.49 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  42.5 
 
 		 164 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  40.62 
 
 		 177 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  39.38 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  43.12 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  39.38 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  39.38 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  39.38 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  41.29 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  43.12 
 
 		 177 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  39.25 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0708  translation initiation factor IF-3  41.38 
 
 		 176 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00002338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  40.74 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  43.12 
 
 		 195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  39.51 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 187 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  39.88 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  43.12 
 
 		 177 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  43.23 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 169 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  41.25 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  39.36 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 		 351 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  41.36 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  40.74 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  42 
 
 		 154 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  39.64 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  41.36 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>