More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1733 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1733  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.128322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  47.54 
 
 		 173 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4551  translation initiation factor IF-3  44.69 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  42.05 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  43.96 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  51.23 
 
 		 169 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  47.56 
 
 		 194 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  48.48 
 
 		 173 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  48.19 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 173 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  49.38 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  45.34 
 
 		 163 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 238 aa  155  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  43.83 
 
 		 178 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 173 aa  154  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  44.83 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  44.83 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  44.83 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  46.06 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  46.05 
 
 		 156 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  45.68 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  44.91 
 
 		 176 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  43.1 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  48.15 
 
 		 173 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  51.75 
 
 		 144 aa  151  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 169 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  41.07 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  42.42 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1988  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1903  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.982503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  42.35 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1975  translation initiation factor IF-3  45.45 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 176 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 173 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  42.42 
 
 		 177 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.51 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 175 aa  148  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  46.05 
 
 		 156 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  44.83 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  44.83 
 
 		 180 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  42.26 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 171 aa  147  8e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 173 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1880  translation initiation factor IF-3  44.24 
 
 		 229 aa  147  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  42.51 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  43.58 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  45.39 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  45.39 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  43.03 
 
 		 277 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  45.34 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 		 174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 357 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  42.53 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  38.86 
 
 		 186 aa  145  6e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0190  translation initiation factor IF-3  41.99 
 
 		 186 aa  145  6e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.140917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 		 252 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  43.1 
 
 		 180 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  40.98 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  46.67 
 
 		 154 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  49.38 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  43.64 
 
 		 171 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  45.1 
 
 		 173 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2824  translation initiation factor IF-3  42.7 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  5.308580000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  42.51 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 159 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  44.74 
 
 		 155 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  41.61 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  42.17 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  43.9 
 
 		 401 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  42.13 
 
 		 396 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  42.24 
 
 		 166 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>