More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0916 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 335 aa  659    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  52.13 
 
 		 329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  49.53 
 
 		 335 aa  298  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  56.51 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  46.79 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  51.01 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  47.95 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  50.34 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  50.84 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  39.07 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  37.73 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  41.95 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  40.79 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  37.27 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  37.27 
 
 		 328 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2370  secretion protein HlyD  42.32 
 
 		 344 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.972198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  38.62 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  38.63 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  43.88 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  42.12 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  43.3 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  41.84 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  41.44 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  40.62 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  31.69 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  36.52 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  37.29 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  37.29 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  37.29 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  38.7 
 
 		 339 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  39.2 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  36.52 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  38.74 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00610  Type I secretion protein, HlyD family  37.69 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  39.13 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  39.13 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  37.92 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  39.13 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  38.18 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1291  HlyD family secretion protein  37.54 
 
 		 477 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.888104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1607  secretion protein, HlyD family  34.72 
 
 		 331 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187993  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  37.29 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1914  multidrug ABC transporter membrane-binding protein  35.45 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178909  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2511  hypothetical protein  36.99 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  35.26 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  39.4 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  37.39 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4061  secretion protein HlyD family protein  35.26 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  40.26 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1521  hypothetical protein  36.3 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  39.5 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2420  hypothetical protein  36.59 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0441115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  32.49 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1020  hypothetical protein  37 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  30.82 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  41.1 
 
 		 377 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0713  hypothetical protein  31.86 
 
 		 281 aa  146  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.96 
 
 		 500 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  32.13 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  30.77 
 
 		 334 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  31.23 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  39.15 
 
 		 541 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  30.53 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  30.2 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  29.72 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  29.01 
 
 		 425 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  31.19 
 
 		 334 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  29.02 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  41.81 
 
 		 541 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.37 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  34.31 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  32.56 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  35.46 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  32.72 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  32.79 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4361  secretion protein HlyD family protein  29.56 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  33.56 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1263  hypothetical protein  33.08 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00237907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  35.52 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  34.54 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  32.27 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1705  HlyD family secretion protein  32.48 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 421 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  31.65 
 
 		 354 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  31.1 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  33.89 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>