More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0209 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  100 
 
 		 153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  61.07 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  63.27 
 
 		 168 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  62 
 
 		 167 aa  181  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 163 aa  176  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  60 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  59.18 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  56.86 
 
 		 163 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 163 aa  173  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  173  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 166 aa  173  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  61.07 
 
 		 205 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  61.74 
 
 		 169 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  61.74 
 
 		 169 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  61.74 
 
 		 169 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  55.26 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  57.14 
 
 		 166 aa  170  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 215 aa  170  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  59.33 
 
 		 199 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  55.78 
 
 		 163 aa  169  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  61.07 
 
 		 168 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.29 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  59.6 
 
 		 205 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  55.56 
 
 		 163 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  58.5 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  57.82 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  59.73 
 
 		 210 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  60.4 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  56.46 
 
 		 173 aa  167  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 202 aa  167  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 202 aa  167  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  57.43 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  55.78 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  56.95 
 
 		 197 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  56.76 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  57.82 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  54.36 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  58.39 
 
 		 222 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00000382419  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  58.62 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  55.15 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  58 
 
 		 215 aa  164  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000541133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  57.62 
 
 		 225 aa  164  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  57.72 
 
 		 223 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000681641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  57.72 
 
 		 223 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  57.72 
 
 		 223 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  56.38 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  57.62 
 
 		 210 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  54.42 
 
 		 166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  54.42 
 
 		 167 aa  163  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 238 aa  163  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  55.86 
 
 		 200 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  55.92 
 
 		 236 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 		 147 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  56 
 
 		 168 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  57.72 
 
 		 220 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000927793  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  53.69 
 
 		 166 aa  160  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 165 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  59.06 
 
 		 200 aa  160  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  54.42 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0799  30S ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0122561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  55.78 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3507  30S ribosomal protein S5  52.67 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000462246  hitchhiker  0.0000000928534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 166 aa  157  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 169 aa  157  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  56.62 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  53.38 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0677  30S ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.780274  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  57.72 
 
 		 200 aa  156  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  52.74 
 
 		 175 aa  156  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  53.1 
 
 		 206 aa  156  9e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  54.79 
 
 		 173 aa  156  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 		 180 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  57.35 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  54.48 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  53.79 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0468  30S ribosomal protein S5  55.88 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  55.86 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  56.3 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  55.86 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0268  ribosomal protein S5  55.1 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  53.95 
 
 		 172 aa  154  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>