More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0799 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0799  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 165 aa  330  8e-90  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0122561  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  57.72 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  51.33 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  50 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  48.68 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  48.03 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  48.03 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  48.03 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  48.32 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  53.06 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  48.68 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  47.37 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  49.06 
 
 		 180 aa  157  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000876107  hitchhiker  0.0000786108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  44.52 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  47.37 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  46.15 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  46.25 
 
 		 162 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  48.34 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  48.1 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  48.05 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  48.99 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  48.67 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  48.37 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  48.37 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  48.32 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  51.68 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  43.95 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  50.68 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  43.12 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  48.32 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  44.94 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  47.22 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  45.83 
 
 		 206 aa  148  4e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  50.33 
 
 		 172 aa  147  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1661  30S ribosomal protein S5  46.36 
 
 		 185 aa  147  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  47.22 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  47.22 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3426  30S ribosomal protein S5  49.34 
 
 		 172 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.19701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  47.68 
 
 		 162 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  49.65 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  46.2 
 
 		 166 aa  147  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  46.41 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  42.68 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1003  30S ribosomal protein S5  45.45 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0840798  decreased coverage  0.00550147 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  48.25 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  45 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  47.65 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0494  ribosomal protein S5  45.22 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.645622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  49.65 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  49.65 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  46.62 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  50 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  49.65 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  46.25 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1167  ribosomal protein S5  42.59 
 
 		 172 aa  145  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0511259  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  47.59 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  48.28 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  48.63 
 
 		 208 aa  144  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2602  30S ribosomal protein S5  44.37 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00539846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  43.95 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  43.95 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  44.52 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0345  ribosomal protein S5  44.23 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0283353  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000003426  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3719  30S ribosomal protein S5  43.4 
 
 		 173 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0187  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820766  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  44.81 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  43.87 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  41.77 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0165  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786846  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  43.51 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000281151  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0506  30S ribosomal protein S5  50.71 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2753  ribosomal protein S5  44.74 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.3085  normal  0.221046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  44.81 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  49.33 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  49.33 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1349  30S ribosomal protein S5  44.16 
 
 		 189 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000960578  normal  0.199719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>