207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3943 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 281 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  59.68 
 
 		 254 aa  305  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  62.86 
 
 		 266 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  60.56 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  63.49 
 
 		 266 aa  298  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  58.47 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  45 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  38.63 
 
 		 245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  41.15 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 		 258 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  32.78 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 		 439 aa  99  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  26.43 
 
 		 443 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  26.72 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  27.6 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  27.67 
 
 		 505 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  25.64 
 
 		 439 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  26.07 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  30.6 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  24 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  25.93 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  29.65 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.36 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0183  prephenate dehydrogenase  29.44 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.5 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0205  Prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.01 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  27.53 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0194  Prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478055  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  26.83 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  32.2 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.17 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  27.53 
 
 		 374 aa  68.9  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  28.68 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.49 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  21.18 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.54 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  25.74 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.81 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.75 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  32.26 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.5 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.98 
 
 		 294 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.82 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.72 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.08 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  26.56 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  34.15 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  27.69 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  31 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.13 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.52 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.37 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.78 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  30.89 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  26.29 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.37 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  31.84 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  27.64 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  27.64 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.71 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  23.71 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.08 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0836  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  24.65 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0203  prephenate dehydrogenase  27.89 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.503225  hitchhiker  0.00431893 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  24.64 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  24.64 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.28 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  27.46 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  26.62 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.51 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>