More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3077 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
582 aa  1186    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  74.4 
 
 
582 aa  890    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  70.45 
 
 
562 aa  805    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
571 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
566 aa  464  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 
600 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  42.68 
 
 
581 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0375  FAD dependent oxidoreductase  42.21 
 
 
587 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
543 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 
550 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
545 aa  238  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 
556 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
552 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
552 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.23 
 
 
557 aa  185  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.24 
 
 
516 aa  183  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.1 
 
 
591 aa  181  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.19 
 
 
551 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 
516 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
543 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.47 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
519 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 
548 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 
567 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.93 
 
 
513 aa  171  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 
576 aa  171  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.63 
 
 
504 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.11 
 
 
526 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.88 
 
 
509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
577 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  29.4 
 
 
546 aa  166  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.54 
 
 
525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.71 
 
 
499 aa  165  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 
546 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.43 
 
 
504 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 
537 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.38 
 
 
495 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.09 
 
 
530 aa  163  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  27.09 
 
 
545 aa  163  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
519 aa  162  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0600  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.93 
 
 
510 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4792  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.67 
 
 
505 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.703258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  29.3 
 
 
517 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0620  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.88 
 
 
507 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45730  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.92 
 
 
510 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.99 
 
 
517 aa  160  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1591  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.29 
 
 
509 aa  160  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0800392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03277  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic, FAD/NAD(P)-binding  28.99 
 
 
501 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0288  FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
501 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  26.37 
 
 
557 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0288  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
501 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.54 
 
 
510 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.5 
 
 
511 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3623  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.99 
 
 
501 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 
578 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.33 
 
 
510 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3808  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.81 
 
 
501 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.389691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
537 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4734  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.13 
 
 
501 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03229  hypothetical protein  28.99 
 
 
501 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
528 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.91 
 
 
502 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5259  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.27 
 
 
505 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.8 
 
 
500 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.87 
 
 
557 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  25.87 
 
 
573 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.9 
 
 
504 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.84 
 
 
531 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0241  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
510 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.570878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6005  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.82 
 
 
507 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0493014  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2453  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
510 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.453717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0740  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
510 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3233  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.66 
 
 
502 aa  158  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.700391  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2705  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
510 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2372  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
510 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
574 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3706  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.6 
 
 
501 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.166207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0726  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 
510 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 
562 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  26.76 
 
 
546 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.98 
 
 
605 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
531 aa  157  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3902  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.78 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03315  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.97 
 
 
519 aa  157  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.04 
 
 
500 aa  156  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.83 
 
 
507 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.14 
 
 
512 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
534 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3320  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.08 
 
 
509 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435615  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
524 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2066  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.21 
 
 
507 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2677  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.21 
 
 
507 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.435115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
527 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  27.02 
 
 
560 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  27.01 
 
 
560 aa  154  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.63 
 
 
513 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>