83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1163 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1163  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 
215 aa  427  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1413  peptidase U35, phage prohead HK97  84.88 
 
 
215 aa  340  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1804  peptidase U35, phage prohead HK97  65.02 
 
 
220 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409036  normal  0.116646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3484  peptidase U35, phage prohead HK97  73.56 
 
 
240 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2095  phage prohead protease, HK97 family  65.67 
 
 
248 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1969  peptidase U35, phage prohead HK97  75.62 
 
 
235 aa  242  4e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.150043  normal  0.71487 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0905  HK97 family phage prohead protease  54.93 
 
 
219 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.963792  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0589  prohead protease  53.57 
 
 
222 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0588  protease, putative  53.57 
 
 
222 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3154  HK97 family phage prohead protease  54.96 
 
 
159 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071533  normal  0.0125341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  51.82 
 
 
189 aa  152  3e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  48.32 
 
 
177 aa  146  2e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  48.32 
 
 
177 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  48.23 
 
 
183 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4964  HK97 family phage prohead protease  57.89 
 
 
184 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00699e-05 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2175  putative phage prohead protease  52.67 
 
 
205 aa  140  2e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1706  phage prohead protease, HK97 family  54.29 
 
 
156 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  0.0428753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1432  HK97 family phage prohead protease  54.29 
 
 
156 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0921  HK97 family phage prohead protease  52.94 
 
 
144 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.340053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  43.67 
 
 
176 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1428  phage prohead protease, HK97 family  53.57 
 
 
157 aa  130  1e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84162  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2899  HK97 family phage prohead protease  53.24 
 
 
185 aa  129  5e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1132  HK97 family phage prohead protease  51.85 
 
 
187 aa  128  7e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2470  prohead peptidase  51.11 
 
 
187 aa  126  2e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1077  HK97 family phage prohead protease  50 
 
 
187 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1060  peptidase U35, phage prohead HK97  43.17 
 
 
190 aa  120  1e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0756377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  43.24 
 
 
231 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  38.64 
 
 
371 aa  114  1e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  33.15 
 
 
177 aa  114  1e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3914  HK97 family phage prohead protease  49.23 
 
 
139 aa  113  2e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768445  normal  0.030965 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  35.77 
 
 
177 aa  112  5e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  34.81 
 
 
177 aa  112  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  43.26 
 
 
240 aa  111  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  41.73 
 
 
228 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  43.38 
 
 
174 aa  108  7e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  34.8 
 
 
228 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  35.81 
 
 
172 aa  98.2  8e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  38.26 
 
 
236 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  4.23537e-09 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  39.49 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  39.16 
 
 
233 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  38.85 
 
 
216 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0860  phage prohead protease, HK97 family  36.69 
 
 
183 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1335  HK97 family phage prohead protease  39.35 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348898  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  38.46 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  35.26 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1896  prohead peptidase  42.34 
 
 
186 aa  88.6  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  40.15 
 
 
165 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  36.11 
 
 
165 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1656  phage prohead protease, HK97 family  39.46 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  40.71 
 
 
150 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3944  HK97 family phage prohead protease  35.04 
 
 
213 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130087  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  40.29 
 
 
171 aa  83.6  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  39.29 
 
 
168 aa  80.5  2e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0868  HK97 family phage prohead protease  36.46 
 
 
250 aa  80.1  3e-14  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.844474  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  39.37 
 
 
165 aa  77.8  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5466  hypothetical protein  34.27 
 
 
167 aa  78.2  1e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  39.37 
 
 
165 aa  77.8  1e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2000  peptidase U35, phage prohead HK97  40.15 
 
 
149 aa  76.3  3e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.639084  hitchhiker  0.00378226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1853  prophage LambdaSa2, protease, putative  31.47 
 
 
180 aa  64.3  1e-09  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.812797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1969  prohead protease protein  30.57 
 
 
198 aa  62.8  4e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.839969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  35.53 
 
 
579 aa  62.4  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12667  phiRv2 prophage protease  34.31 
 
 
177 aa  60.8  2e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.81998e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  27.37 
 
 
506 aa  55.1  9e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  22.63 
 
 
562 aa  52  8e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.33544e-10 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0445  prophage LambdaBa04, prohead protease  31.45 
 
 
196 aa  51.6  1e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0467  prophage lambdaba04, prohead protease  31.45 
 
 
196 aa  51.6  1e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2272  phage prohead protease, HK97 family  29.3 
 
 
220 aa  49.3  5e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1696  phage prohead protease, HK97 family  29.3 
 
 
220 aa  49.3  5e-05  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5151  HK97 family phage prohead protease  32.56 
 
 
169 aa  49.3  5e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.369538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0952  HK97 family phage prohead protease  32.61 
 
 
186 aa  49.3  5e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  34.52 
 
 
420 aa  48.9  5e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  28.02 
 
 
526 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1285  HK97 family phage prohead protease  32.37 
 
 
177 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  30 
 
 
526 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  30 
 
 
526 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  34.91 
 
 
646 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0462  prohead peptidase  28.57 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.523107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2594  HK97 family phage prohead protease  29.31 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3508  prophage LambdaBa01, prohead protease  28.67 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.677368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3425  prohead protease  28.67 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3785  prophage lambdaba01, prohead protease  28.67 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3429  HK97 family phage prohead protease  28.67 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1585  HK97 family phage prohead protease  29.05 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00257234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>