More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4044 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 238 aa  470  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  53.05 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  52.13 
 
 		 219 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  50.23 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  49.77 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  49.3 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  49.31 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  50.71 
 
 		 218 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  46.51 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  46.01 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.54 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  46.01 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  47.64 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 220 aa  175  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  42.33 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  44.08 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  45.07 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  46.73 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  43.6 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  41.31 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  42.99 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  41.51 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  40.85 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  43.13 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  43.13 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  44.29 
 
 		 214 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  42.38 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  38.86 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 222 aa  139  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.38 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.68 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.79 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 218 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 215 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.66 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  27.83 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 219 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 222 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  32.11 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.91 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  31.91 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.18 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.4 
 
 		 224 aa  98.6  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  32.54 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3367  phosphate uptake regulator, PhoU  33.68 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  31.25 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  36.96 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  33.79 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30.33 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.97 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>