More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2855 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 712 aa  1402    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  53.19 
 
 		 535 aa  343  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  46.13 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 572 aa  240  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  40.97 
 
 		 551 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0866  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 555 aa  229  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 1291 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2879  histidine kinase  39.95 
 
 		 553 aa  223  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 587 aa  210  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 1516 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1075 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 575 aa  203  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08080  signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 569 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.672311  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 		 625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16710  signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 554 aa  197  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0521739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 		 1010 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 874 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 885 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 597 aa  188  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 833 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1088 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  47.16 
 
 		 423 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1099 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 514 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.3 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.3 
 
 		 587 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1297 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.03 
 
 		 587 aa  171  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.85 
 
 		 587 aa  171  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 1039 aa  170  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  30.77 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  30.77 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  30.77 
 
 		 587 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  30.77 
 
 		 587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 408 aa  168  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4317  ATPase domain-containing protein  43.88 
 
 		 600 aa  168  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  30.77 
 
 		 587 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 958 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 1042 aa  165  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 3470 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  27.86 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 585 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  36.1 
 
 		 502 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 		 401 aa  160  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 2161 aa  160  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 		 933 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 589 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 510 aa  159  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 639 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 637 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 582 aa  157  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 827 aa  157  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 639 aa  156  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 608 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 2783 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 577 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 639 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 		 1002 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 2153 aa  154  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 701 aa  154  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 953 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 944 aa  154  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 682 aa  154  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 		 1559 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  46.09 
 
 		 725 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  40.45 
 
 		 628 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 		 1501 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1002 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.39 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  42.67 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 584 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 		 1041 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 1965 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 612 aa  151  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  39.32 
 
 		 593 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1331 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0404  Signal transduction histidine kinase-like  39.47 
 
 		 498 aa  150  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 566 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 		 1177 aa  150  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 815 aa  150  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  39.58 
 
 		 537 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 412 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 1391 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 1207 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 641 aa  148  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 563 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.07 
 
 		 1468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  35.12 
 
 		 598 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  40.85 
 
 		 352 aa  147  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  28.96 
 
 		 554 aa  147  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>