More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1511 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  874    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 425 aa  438  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 423 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 455 aa  366  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  41.47 
 
 		 427 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 420 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 423 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 424 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 424 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 423 aa  355  6.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 421 aa  350  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 423 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 425 aa  348  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 426 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 422 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 426 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 421 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 427 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 430 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 427 aa  338  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  39.33 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0551  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 433 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0575  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 426 aa  335  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 427 aa  335  5.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 433 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 428 aa  335  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 426 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 432 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 422 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>