More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0068 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0068  class I glutamine amidotransferase  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.919484 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  31.98 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  25.91 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  26.42 
 
 		 525 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  30.21 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  28.72 
 
 		 517 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 		 517 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  31.38 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  26.18 
 
 		 532 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  28.88 
 
 		 513 aa  76.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  26.67 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  26.67 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  26.67 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.7  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  26.98 
 
 		 517 aa  74.7  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.7  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  25.39 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  25.64 
 
 		 525 aa  74.3  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  24.87 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  24.87 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  26.53 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  24.87 
 
 		 525 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  24.35 
 
 		 525 aa  72  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  33.8 
 
 		 522 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  24.87 
 
 		 522 aa  71.6  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  27.75 
 
 		 525 aa  70.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  24.23 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  25.13 
 
 		 525 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  28.95 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  36.7 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  31.58 
 
 		 507 aa  69.3  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  31.05 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  29.69 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  28.88 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  24.1 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0899  GMP synthase  26.2 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  25 
 
 		 520 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  30.39 
 
 		 516 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0650  GMP synthase  26.42 
 
 		 526 aa  68.6  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.331124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  24.19 
 
 		 515 aa  68.6  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  25.68 
 
 		 508 aa  68.6  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  26.74 
 
 		 518 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  25.39 
 
 		 526 aa  67.8  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  25.81 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  23.32 
 
 		 525 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  36.28 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1032  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  28.93 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0378  GMP synthase, large subunit  30 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  27.03 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  27.51 
 
 		 514 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0445  GMP synthase  24.6 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.323324  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02180  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.62 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  27.51 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  25.64 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  23.71 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0655  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  25.99 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197723 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05566  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (EC 6.3.5.2)(Glutamine amidotransferase)(GMP synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1L4]  28.87 
 
 		 533 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152629  normal  0.706749 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  27.22 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  26.2 
 
 		 511 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  27.06 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  25.13 
 
 		 525 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0991  glutamine amidotransferase class-I  33.94 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  26.56 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1687  GMP synthase  26.42 
 
 		 525 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1686  GMP synthase  26.42 
 
 		 525 aa  65.1  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  28.91 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  25.53 
 
 		 520 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  30 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  25.91 
 
 		 525 aa  65.1  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  23.39 
 
 		 511 aa  65.1  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  27.03 
 
 		 507 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  28.11 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  27.96 
 
 		 509 aa  65.1  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  33.03 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  25.4 
 
 		 520 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  25.81 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  25 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  25.81 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  25.81 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  30.23 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  27.17 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  27.13 
 
 		 536 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  23.71 
 
 		 525 aa  64.3  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  25.27 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  25.26 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  27.27 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  27.13 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  28.12 
 
 		 507 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  24.47 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  25.27 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  25.53 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  24.16 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>