More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5272 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  83.14 
 
 		 422 aa  680    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 436 aa  884    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  75.66 
 
 		 420 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  74.7 
 
 		 418 aa  637    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 421 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  71.9 
 
 		 421 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  71.05 
 
 		 416 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 420 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  65.55 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  66.99 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 445 aa  542  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  65.63 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  65.16 
 
 		 419 aa  538  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 417 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  65.39 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 419 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 417 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  65.08 
 
 		 422 aa  536  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  64.64 
 
 		 426 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 424 aa  532  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  65.49 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 426 aa  521  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  66.18 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 424 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  56.5 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 428 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 411 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 425 aa  348  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 422 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 435 aa  337  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 425 aa  334  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 422 aa  332  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 421 aa  329  7e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 423 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 424 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 421 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 423 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 431 aa  319  5e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1830  seryl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>