190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4712 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  100 
 
 		 408 aa  834    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  66.91 
 
 		 408 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  64.41 
 
 		 405 aa  513  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  57.61 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  36.25 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  38.27 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  36.36 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  36.5 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  34.63 
 
 		 415 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  39.25 
 
 		 444 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  37.13 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  35.38 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  39.8 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  35.32 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  34.89 
 
 		 433 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  37.5 
 
 		 427 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  32.35 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  37.31 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  33.58 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  32.11 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  34.77 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  35.84 
 
 		 410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  32.92 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  34.31 
 
 		 431 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  36.27 
 
 		 409 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  37.63 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 		 420 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  35.82 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  35.96 
 
 		 413 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  36.59 
 
 		 373 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  36.03 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  35.29 
 
 		 409 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  36.03 
 
 		 411 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  33.74 
 
 		 407 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  33.9 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  34.55 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  33.25 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  33.42 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  30.37 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  34.07 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  31.78 
 
 		 407 aa  215  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  31.78 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  32.03 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  31.3 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  31.3 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  35.14 
 
 		 438 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  33.66 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.46 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.63 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  29.08 
 
 		 400 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  29.08 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.56 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.72 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  26.59 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.9 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  29.73 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.56 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  24.56 
 
 		 412 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.97 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  32.52 
 
 		 178 aa  95.9  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.57 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  28.1 
 
 		 359 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  27.6 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.55 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.94 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  25.5 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  26.59 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  25 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.37 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  24.88 
 
 		 817 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  24.38 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  23.16 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.39 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  24.51 
 
 		 310 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 1177 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 1177 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  26.65 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.92 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 240 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  24.26 
 
 		 300 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 233 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.35 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 317 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.87 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  23.35 
 
 		 282 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  22.49 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  28.28 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  25.91 
 
 		 336 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 513 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2117  protein of unknown function DUF938  31.15 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.143644 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  32.28 
 
 		 206 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 1037 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 303 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 270 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.67 
 
 		 253 aa  50.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>