100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5774 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  100 
 
 
516 aa  1025    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  56.25 
 
 
524 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  55.68 
 
 
517 aa  354  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  55.11 
 
 
519 aa  349  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  44.17 
 
 
578 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  43.72 
 
 
581 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  43.72 
 
 
581 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  43.92 
 
 
578 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  43.6 
 
 
539 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  39.68 
 
 
546 aa  217  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  43.7 
 
 
550 aa  217  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  50.81 
 
 
593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  50.81 
 
 
593 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  37.38 
 
 
586 aa  213  9e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  55.78 
 
 
578 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  55.78 
 
 
578 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  37.04 
 
 
571 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  40.17 
 
 
550 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  37.09 
 
 
593 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  38.57 
 
 
488 aa  203  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  38.57 
 
 
511 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  39.11 
 
 
508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  39.11 
 
 
508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  38.26 
 
 
532 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  42.42 
 
 
519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  41.35 
 
 
514 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  37.56 
 
 
601 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  38.7 
 
 
582 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  56.65 
 
 
512 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  41.37 
 
 
480 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  41.37 
 
 
480 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  41.37 
 
 
480 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  41.56 
 
 
491 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  40.6 
 
 
506 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  40.94 
 
 
491 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  40.94 
 
 
491 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  41.46 
 
 
516 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  41.32 
 
 
508 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  41.32 
 
 
508 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  36.56 
 
 
620 aa  184  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  46.82 
 
 
601 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  47.52 
 
 
441 aa  169  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  46.55 
 
 
464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.86 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  46.11 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  35.52 
 
 
567 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  51.55 
 
 
122 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  62.32 
 
 
535 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  49.41 
 
 
620 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  42.05 
 
 
709 aa  76.6  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  45.68 
 
 
748 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  42.14 
 
 
602 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  40.74 
 
 
566 aa  74.3  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  39.8 
 
 
743 aa  73.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  44.25 
 
 
714 aa  71.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.09 
 
 
535 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  44 
 
 
117 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  40.69 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  43.88 
 
 
498 aa  66.6  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  37.96 
 
 
530 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  41.3 
 
 
434 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  27.62 
 
 
579 aa  65.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  41.61 
 
 
129 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  41.3 
 
 
427 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  36.07 
 
 
628 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  40.82 
 
 
443 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  38.71 
 
 
565 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  37.78 
 
 
443 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  45.07 
 
 
618 aa  60.8  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  42.55 
 
 
635 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  37.76 
 
 
567 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  33.33 
 
 
499 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  36.73 
 
 
426 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  50 
 
 
603 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  38.71 
 
 
605 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  43.33 
 
 
131 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.93 
 
 
510 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  37.63 
 
 
198 aa  55.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  39.32 
 
 
551 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.26 
 
 
519 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  30.57 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  28.79 
 
 
580 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  41.67 
 
 
580 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  36.46 
 
 
516 aa  50.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  41.67 
 
 
558 aa  50.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  40.91 
 
 
584 aa  50.4  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  37.78 
 
 
585 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  38.89 
 
 
568 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  40.22 
 
 
566 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  35.05 
 
 
169 aa  48.5  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  38.89 
 
 
620 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  39.19 
 
 
360 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  35.64 
 
 
512 aa  47  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  37.23 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  33.33 
 
 
454 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  37.93 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  34.29 
 
 
556 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  39.47 
 
 
432 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  35.29 
 
 
521 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  36.78 
 
 
410 aa  43.5  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>