More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1741 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.28 
 
 		 601 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.94 
 
 		 592 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.28 
 
 		 595 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  54.65 
 
 		 595 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.95 
 
 		 589 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06640  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.28 
 
 		 592 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  56.95 
 
 		 595 aa  707    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.6 
 
 		 597 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.36 
 
 		 598 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.94 
 
 		 601 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.78 
 
 		 595 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.19 
 
 		 598 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.559108 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.94 
 
 		 597 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.09 
 
 		 596 aa  795    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0885  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.69 
 
 		 596 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.894915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  54.1 
 
 		 601 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  54.61 
 
 		 592 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.12 
 
 		 595 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.54 
 
 		 598 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  54.94 
 
 		 592 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  54.77 
 
 		 601 aa  673    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.71 
 
 		 598 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.95 
 
 		 601 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  52.1 
 
 		 597 aa  637    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1224  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.35 
 
 		 598 aa  646    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.28 
 
 		 601 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.74 
 
 		 594 aa  945    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 594 aa  1221    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.61 
 
 		 601 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  55.78 
 
 		 595 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.02 
 
 		 596 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.95 
 
 		 592 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.94 
 
 		 599 aa  681    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.78 
 
 		 595 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3101  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.93 
 
 		 592 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.165418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.28 
 
 		 601 aa  685    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.11 
 
 		 592 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  57.05 
 
 		 598 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  54.44 
 
 		 601 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.95 
 
 		 595 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.78 
 
 		 595 aa  714    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0419  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  55.35 
 
 		 596 aa  671    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.45 
 
 		 599 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.95 
 
 		 601 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0515  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.76 
 
 		 591 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  69.3 
 
 		 596 aa  859    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.95 
 
 		 595 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.35 
 
 		 592 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.01 
 
 		 596 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  53.86 
 
 		 596 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.11 
 
 		 595 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.69 
 
 		 592 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2970  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.43 
 
 		 591 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108103  normal  0.100369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0609  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.45 
 
 		 592 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.09 
 
 		 601 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3477  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.68 
 
 		 598 aa  654    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.12 
 
 		 595 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3519  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.85 
 
 		 598 aa  656    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.48 
 
 		 595 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.92 
 
 		 598 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0737  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.19 
 
 		 596 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.71 
 
 		 590 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.11 
 
 		 597 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.78 
 
 		 595 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.53 
 
 		 598 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.94 
 
 		 597 aa  669    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  55.95 
 
 		 595 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  61.91 
 
 		 596 aa  790    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.68 
 
 		 598 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0804  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.69 
 
 		 596 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2868  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.12 
 
 		 592 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.259312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  53.94 
 
 		 603 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.36 
 
 		 595 aa  658    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5238  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.61 
 
 		 597 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.69 
 
 		 593 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  52.27 
 
 		 597 aa  641    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.52 
 
 		 601 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  57.45 
 
 		 595 aa  713    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.12 
 
 		 595 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.95 
 
 		 595 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0839  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.17 
 
 		 592 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.704355 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.11 
 
 		 595 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.41 
 
 		 600 aa  654    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  57.86 
 
 		 593 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.12 
 
 		 595 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.11 
 
 		 595 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4089  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.92 
 
 		 601 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.29 
 
 		 595 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.53 
 
 		 589 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0023  acyl-CoA dehydrogenase-like  53.18 
 
 		 598 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.95 
 
 		 626 aa  827    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2220  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.28 
 
 		 594 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.45 
 
 		 597 aa  680    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  54.52 
 
 		 597 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5262  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.63 
 
 		 590 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.935706  hitchhiker  0.000268053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.68 
 
 		 598 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.77 
 
 		 597 aa  638    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.18 
 
 		 592 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4032  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.34 
 
 		 596 aa  644    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000200788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3569  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.19 
 
 		 596 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>