More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0209 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  71.96 
 
 		 604 aa  912    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 604 aa  933    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 600 aa  662    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 596 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 609 aa  722    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 591 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 595 aa  719    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  63.42 
 
 		 590 aa  793    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 596 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  53.28 
 
 		 590 aa  668    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  64.7 
 
 		 590 aa  806    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  58.91 
 
 		 599 aa  724    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 623 aa  775    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  73.24 
 
 		 625 aa  933    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 591 aa  706    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 595 aa  734    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  72.76 
 
 		 604 aa  922    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 		 614 aa  915    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  76.73 
 
 		 597 aa  980    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  61.44 
 
 		 606 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 		 590 aa  794    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 		 593 aa  742    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 590 aa  672    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 591 aa  666    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 590 aa  797    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 		 590 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  64.16 
 
 		 590 aa  802    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 590 aa  683    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 594 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 619 aa  740    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 595 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 591 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  59.74 
 
 		 594 aa  740    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 623 aa  1277    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  61.19 
 
 		 593 aa  744    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 601 aa  718    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 605 aa  690    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 596 aa  719    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  57.19 
 
 		 595 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 591 aa  796    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 595 aa  719    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 591 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  72.12 
 
 		 604 aa  908    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 607 aa  764    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 605 aa  609  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 604 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 608 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 588 aa  600  1e-170  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 605 aa  597  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 601 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 606 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 581 aa  568  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 603 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 600 aa  530  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 598 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 594 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 598 aa  511  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 589 aa  508  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 588 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 597 aa  504  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 602 aa  502  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 598 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 591 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 589 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 599 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 599 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 592 aa  489  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 594 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 591 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 604 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 590 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 619 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 590 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 597 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 594 aa  485  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 591 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 590 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 613 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 617 aa  485  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 598 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 589 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1847  aspartyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 626 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 591 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 597 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 600 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>