More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1454 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  526  1e-148  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  55.25 
 
 
267 aa  263  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  35.78 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 
306 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  37.31 
 
 
308 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  38.32 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  35.08 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  31.84 
 
 
306 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  30.64 
 
 
310 aa  96.3  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  32.66 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  30.28 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  32.6 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.21 
 
 
312 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 
308 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  30.15 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  33.9 
 
 
307 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
322 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  31.31 
 
 
310 aa  85.9  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  28.87 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  28 
 
 
316 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  32.57 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  32.48 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  28.51 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.29 
 
 
316 aa  79  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  32.2 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  26.76 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  32.93 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  34.17 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2372  putative hydrolase  30.56 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  27.98 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  25.45 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2960  putative hydrolase  29.63 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047526 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  25.18 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  28.83 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  31.08 
 
 
298 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  26.97 
 
 
320 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  26.82 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1765  beta-lactamase domain protein  26.13 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1181  beta-lactamase domain protein  23.9 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  25.36 
 
 
297 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2218  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
217 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.250629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
323 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 
301 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
323 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
326 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2440  hydrolase, putative  28.71 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0911202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  29.37 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  27.42 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  29.37 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  29.37 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1345  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  24.84 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 
318 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1796  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
230 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  26.38 
 
 
201 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1442  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
203 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 
192 aa  58.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2241  hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  28.87 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2175  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000879537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2422  putative hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2405  hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.903974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  28.67 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2161  metal-dependent hydrolase  28.78 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57885  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3157  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  27.1 
 
 
209 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  27.7 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  29.61 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2505  putative hydrolase  29.27 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  26.47 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 
545 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  32.14 
 
 
214 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  26.57 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0513  beta-lactamase domain-containing protein  27.12 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000126924  hitchhiker  0.000693595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0383  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 
213 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  28.1 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  30.14 
 
 
318 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 
208 aa  55.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  27.49 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 
205 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2769  metallo-beta-lactamase family protein  27.91 
 
 
295 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 
214 aa  55.5  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>