More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0042 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0042  30S ribosomal protein S10P  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000120116  normal  0.273764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1195  ribosomal protein S10  83.33 
 
 		 102 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1169  30S ribosomal protein S10P  55.45 
 
 		 103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0074  ribosomal protein S10  55.1 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0042171  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0822  30S ribosomal protein S10P  56.57 
 
 		 102 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1554  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0157  30S ribosomal protein S10P  53.54 
 
 		 102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0097  30S ribosomal protein S10P  50.98 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.718504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0496  30S ribosomal protein S10P  52.48 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.629628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0810  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3684  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0698  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.135544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0729  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1440  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1593  30S ribosomal protein S10P  52.53 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0648  30S ribosomal protein S10P  50.98 
 
 		 109 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000577267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0207  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 102 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.271258  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1033  30S ribosomal protein S10  49.5 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0681  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0616  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  111  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0781  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1302  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3065  ribosomal protein S10  52.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2517  ribosomal protein S10  52.04 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1817  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00457841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0354  30S ribosomal protein S10P  50.51 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0987  30S ribosomal protein S10P  51.52 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000883744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0304  30S ribosomal protein S10P  49.49 
 
 		 106 aa  102  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51291  predicted protein  34 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00204375  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0488  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.149423  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30430  Ribosomal protein S20, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.67 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0524251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  35.29 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2660  ribosomal protein S10  39 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85261  ribosomal protein S20  32 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.827129  normal  0.0953381 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04594  40S ribosomal protein S10a (AFU_orthologue; AFUA_2G02150)  31.31 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17101  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1073  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2023  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.532021  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16981  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16871  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19481  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29750  SSU ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  34.31 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0586  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.306746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20880  SSU ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0626  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17170  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0484484  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01410  ribosomal protein S20, putative  30.3 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23820  SSU ribosomal protein S10P  38 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  38 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0292  30S ribosomal protein S10  39.22 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0377689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3144  ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0968346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1185  ribosomal protein S10  33.33 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000082912  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0687  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2976  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430962  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2688  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.832571 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  37 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  36.89 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1908  30S ribosomal protein S10  34.95 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000309802  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1706  30S ribosomal protein S10  37.37 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  38 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  35 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0057  30S ribosomal protein S10  33.98 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000459643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  39 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1184  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0592971 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0700  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000505972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  33.66 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3906  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1039  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03970  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.914635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1012  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5050  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.38543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1029  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.632906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1304  30S ribosomal protein S10  36.36 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155802  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  36 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  35.29 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  37 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  37.11 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>