More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1614 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  100 
 
 
101 aa  206  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  89 
 
 
101 aa  184  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  87 
 
 
101 aa  181  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  87.76 
 
 
103 aa  178  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  83 
 
 
101 aa  174  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  81 
 
 
101 aa  174  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  79 
 
 
101 aa  172  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  77 
 
 
101 aa  166  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  73.27 
 
 
101 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  75 
 
 
101 aa  156  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  70.71 
 
 
102 aa  154  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 
102 aa  146  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  66.33 
 
 
102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  63.27 
 
 
102 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  64.29 
 
 
103 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  140  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  61.62 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
102 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1484  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000272811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
102 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  60.2 
 
 
103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
103 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0195  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
102 aa  134  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00451174  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  134  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
103 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
103 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
103 aa  133  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1163  ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  133  8e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000940072  hitchhiker  0.000000509949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  63.27 
 
 
103 aa  133  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
104 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  60.4 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  57.14 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0104  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000227261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 
102 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5196  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000324324  unclonable  1.19812e-25 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
103 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0140  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000306915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0130  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0105  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.602740000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0103  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000504345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0121  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5859e-62 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0319  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717692  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  60.2 
 
 
104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0103  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  59.41 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0305  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 
109 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 
101 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  62.24 
 
 
103 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0109  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000428723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0109  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000209715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0581  30S ribosomal protein S10  59.6 
 
 
102 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 
123 aa  130  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
103 aa  130  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2647  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  130  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
104 aa  130  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
104 aa  130  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
104 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6050  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0825788  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0457  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 
103 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1535  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
104 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1560  30S ribosomal protein S10  58 
 
 
104 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16301  30S ribosomal protein S10  57.14 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0707  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
105 aa  130  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1599  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
106 aa  129  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0106  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0453  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0704355  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0625  ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000466292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1746  30S ribosomal protein S10  55.56 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000231589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4549  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000213954  normal  0.0597614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16250  SSU ribosomal protein S10P  57.58 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00216069  hitchhiker  0.00000702102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0663  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1286  30S ribosomal protein S10  59.18 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00174582  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5080  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000793453  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0110  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000437851  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  64 
 
 
101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0477  30S ribosomal protein S10  58.16 
 
 
105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0395283  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08840  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000352676  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4322  ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4750  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 
103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000671466  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0930  30S ribosomal protein S10  58.59 
 
 
102 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>