More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4342 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4342  30S ribosomal protein S10  100 
 
 		 101 aa  204  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0589307  normal  0.109776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3163  30S ribosomal protein S10  88.12 
 
 		 101 aa  188  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.547346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5570  ribosomal protein S10  88.12 
 
 		 101 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.966668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05710  30S ribosomal protein S10  82.18 
 
 		 101 aa  175  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.751469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0598  ribosomal protein S10  81.19 
 
 		 101 aa  174  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1146  30S ribosomal protein S10  80 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00144145  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0398  30S ribosomal protein S10  78.22 
 
 		 101 aa  168  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1614  ribosomal protein S10  77 
 
 		 101 aa  166  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0124  30S ribosomal protein S10  78 
 
 		 101 aa  165  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0841  ribosomal protein S10  75 
 
 		 102 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1939  30S ribosomal protein S10  76.24 
 
 		 101 aa  157  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2461  30S ribosomal protein S10  64.65 
 
 		 102 aa  143  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.043315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0214  ribosomal protein S10  62 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0285  ribosomal protein S10  62 
 
 		 102 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0119984  hitchhiker  0.00531479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0224  ribosomal protein S10  61 
 
 		 102 aa  140  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0318  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.1858999999999998e-21  hitchhiker  0.0000342143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2065  30S ribosomal protein S10  65 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000262077  normal  0.381336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01160  ribosomal protein S10  62 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000349687  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0272  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.0000000000156586  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0179  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000562136  normal  0.948551 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1852  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00631354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1575  ribosomal protein S10  64 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000000735097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0337  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012954  decreased coverage  0.000295628 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0288  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2334  ribosomal protein S10  59.6 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000521962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  136  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3796  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000453996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0859  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 109 aa  135  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.591238  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0049  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000291739  decreased coverage  2.20907e-25 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2902  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2230  30S ribosomal protein S10  63 
 
 		 103 aa  135  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2424  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 		 103 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0052526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1263  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2297  30S ribosomal protein S10  66 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238807  hitchhiker  0.00325794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0866  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000610931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4916  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0255  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000004332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2325  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000023421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0202  30S ribosomal protein S10  60.61 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0457  30S ribosomal protein S10  62 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  63.64 
 
 		 104 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  63.64 
 
 		 101 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0290  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153979  unclonable  7.221610000000001e-29 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2373  30S ribosomal protein S10  62.63 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.837203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0488  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000350893  hitchhiker  0.00967015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0420  SSU ribosomal protein S10P  61 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00124832  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0483  30S ribosomal protein S10  61.22 
 
 		 103 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000105944  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0766  30S ribosomal protein S10  65.31 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000754172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0193  SSU ribosomal protein S10P  61.62 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000113928  normal  0.060255 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2170  ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00128539  normal  0.372781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0468  30S ribosomal protein S10  59 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000173961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0757  30S ribosomal protein S10  61.62 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2712  ribosomal protein S10  59.6 
 
 		 102 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00444  30S ribosomal protein S10  60 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0405184  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  61 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0476  ribosomal protein S10  58.59 
 
 		 108 aa  134  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1525  ribosomal protein S10  59 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.651999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>