More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2649 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2649  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 386 aa  772    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000293817  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2492  Extracellular ligand-binding receptor  63.31 
 
 		 387 aa  465  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.977518  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1892  extracellular ligand-binding receptor  45.66 
 
 		 422 aa  315  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.130266  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1863  Extracellular ligand-binding receptor  45.18 
 
 		 814 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.190846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1205  extracellular ligand-binding receptor  44.89 
 
 		 384 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00000303202  normal  0.322412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2975  extracellular ligand-binding receptor  45.66 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.225754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1636  extracellular ligand-binding receptor  45 
 
 		 384 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0385235  normal  0.485465 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6393  extracellular ligand-binding receptor  35.92 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0620  extracellular ligand-binding receptor  37.17 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6456  extracellular ligand-binding receptor  36 
 
 		 383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.411469  normal  0.286463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  35.73 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1435  extracellular ligand-binding receptor  35.39 
 
 		 383 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0735342  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6618  extracellular ligand-binding receptor  33.96 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.868668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5337  Extracellular ligand-binding receptor  32.61 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.958288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  38.07 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  36.99 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  36.64 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  35.69 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  34.63 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1730  extracellular ligand-binding receptor  35.54 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  34.81 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  36.73 
 
 		 378 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  33.8 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  36.81 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  36.81 
 
 		 378 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26140  ABC trasporter substrate binding protein  35.89 
 
 		 371 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  36.46 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3203  extracellular ligand-binding receptor  35.46 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.458632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  34.99 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  36.57 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2729  extracellular ligand-binding receptor  34.72 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2101  Extracellular ligand-binding receptor  38.23 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5889  extracellular ligand-binding receptor  31.55 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4031  putative periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0165  outative extracellular ligand binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3957  putative periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3323  Extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41386 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3027  putative periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2966  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.47 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3344  putative periplasmic substrate-binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1575  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.47 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2733  Extracellular ligand-binding receptor  37.65 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3145  Extracellular ligand-binding receptor  33.97 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00633656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0270  extracellular ligand-binding receptor  35.01 
 
 		 460 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.186259  normal  0.56965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.59 
 
 		 402 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3067  Extracellular ligand-binding receptor  35.58 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3300  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  34.3 
 
 		 381 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.98 
 
 		 399 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  36.12 
 
 		 376 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.12 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4030  extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3492  extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.839805 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.12 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  34.62 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  33.43 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.12 
 
 		 380 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1592  leucine-specific binding precursor transmembrane protein  35.6 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.12 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  36.12 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  36.12 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  34.54 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.12 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3401  extracellular ligand-binding receptor  35.96 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4919  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.97 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  35.04 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3295  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35 
 
 		 379 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0114756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.82 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2938  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.25 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3300  putative amino-acid transport signal peptide protein  34.76 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3510  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  34.32 
 
 		 371 aa  206  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2166  extracellular ligand-binding receptor  34.72 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.0643115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  33.82 
 
 		 381 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0597  extracellular ligand-binding receptor  37.75 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  35.52 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.12 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4758  extracellular ligand-binding receptor  34.56 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0129  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  35.52 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2941  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.70065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1044  extracellular ligand-binding receptor  33.24 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0114  extracellular ligand-binding receptor  34.44 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  35.52 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1047  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.545009 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  34.86 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  34.05 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0113  extracellular ligand-binding receptor  33.89 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  34.12 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  35.14 
 
 		 384 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0115  extracellular ligand-binding receptor  34.53 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0104  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  35.18 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3989  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.143637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.52 
 
 		 380 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  33.61 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  35.43 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>