More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2228 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 101 aa  199  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  83.17 
 
 		 101 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  55.24 
 
 		 103 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 102 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  54 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 104 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  103  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 123 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  47.47 
 
 		 99 aa  100  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  99.4  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1192  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108547  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  47.57 
 
 		 223 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0957  50S ribosomal protein L21P  52.04 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000239901  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0455  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000169225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  49 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  98.6  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.6 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  97.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 104 aa  97.1  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.46 
 
 		 198 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  52 
 
 		 188 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 129 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1370  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 104 aa  94.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000286753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>