More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5472 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  862    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  60.1 
 
 		 450 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  52 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  50.12 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  50 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  49.52 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  50 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  50 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  49.41 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  43.65 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 449 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 452 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  43.13 
 
 		 453 aa  352  8e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  43.37 
 
 		 453 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  42.89 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  42.89 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 453 aa  349  5e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  42.13 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 431 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 438 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  41.12 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  41.3 
 
 		 447 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  35.82 
 
 		 449 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.08 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 446 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 443 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 436 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 416 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  34.34 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  32.78 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 436 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 419 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 444 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  31.92 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  31.92 
 
 		 430 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 442 aa  212  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  31.92 
 
 		 430 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  31.92 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  31.92 
 
 		 430 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 467 aa  212  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  31.92 
 
 		 445 aa  212  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  32.62 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  31.92 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  33.41 
 
 		 454 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 449 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  30.53 
 
 		 453 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  31.69 
 
 		 430 aa  209  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 458 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  33.17 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  33.17 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 447 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  33.5 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 454 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  32.19 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  29.82 
 
 		 454 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.89 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  31.7 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  30.7 
 
 		 461 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  30.94 
 
 		 485 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  30.33 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  30.47 
 
 		 461 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  30.33 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  32.93 
 
 		 434 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 455 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  31.9 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  32.2 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  32.22 
 
 		 447 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  30.72 
 
 		 485 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.47 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  34.47 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  34.47 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  34.47 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  34.47 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>