170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1292 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  100 
 
 
276 aa  539  1e-152  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  92.42 
 
 
277 aa  469  1e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  86.28 
 
 
279 aa  438  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  92.28 
 
 
278 aa  438  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  82.56 
 
 
276 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  1.18187e-05 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  64.95 
 
 
288 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  65.52 
 
 
288 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  64.12 
 
 
299 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  65.53 
 
 
288 aa  268  6e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  61.41 
 
 
296 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  61.41 
 
 
296 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  57.65 
 
 
302 aa  261  7e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  59.66 
 
 
287 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  56.07 
 
 
302 aa  254  1e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  60.33 
 
 
296 aa  253  2e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  60.62 
 
 
287 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  60.74 
 
 
294 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  62.23 
 
 
290 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  61.03 
 
 
285 aa  245  7e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  60.63 
 
 
289 aa  244  2e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  60.63 
 
 
289 aa  244  2e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  61.51 
 
 
290 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  61.51 
 
 
290 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  55 
 
 
279 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  61.38 
 
 
288 aa  238  6e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  61.38 
 
 
288 aa  238  6e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  61.03 
 
 
288 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  59.52 
 
 
285 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  58.06 
 
 
287 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  57.09 
 
 
294 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  51.09 
 
 
274 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  45.26 
 
 
274 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  45.26 
 
 
274 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  41.18 
 
 
283 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  42.62 
 
 
285 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  42.62 
 
 
285 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  43.27 
 
 
284 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  42.76 
 
 
285 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  45.09 
 
 
287 aa  139  4e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  43.57 
 
 
246 aa  134  2e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  42.96 
 
 
284 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  49.26 
 
 
243 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  35.51 
 
 
240 aa  121  1e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  35.87 
 
 
240 aa  120  2e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  38.35 
 
 
571 aa  121  2e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  47.48 
 
 
254 aa  118  1e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  37.77 
 
 
583 aa  116  4e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  1.22606e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  46.67 
 
 
245 aa  114  2e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  37.5 
 
 
258 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  35.99 
 
 
261 aa  111  2e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  37.72 
 
 
248 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  38.07 
 
 
244 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  43.46 
 
 
250 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  35.98 
 
 
250 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  37.28 
 
 
452 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  34.82 
 
 
232 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  33.08 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  38.83 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  34.77 
 
 
207 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  35.23 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  35.14 
 
 
212 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  31.1 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  36.57 
 
 
237 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  33.85 
 
 
206 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.89 
 
 
453 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  38.46 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  32.82 
 
 
577 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  33.1 
 
 
236 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.8 
 
 
207 aa  85.1  1e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  33.85 
 
 
447 aa  84.7  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  35.38 
 
 
710 aa  83.6  3e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.54 
 
 
206 aa  83.2  5e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  33.33 
 
 
237 aa  82.4  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.78 
 
 
207 aa  82.4  8e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  32.16 
 
 
237 aa  81.6  1e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  32.56 
 
 
243 aa  81.3  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4377  putative outer-membrane protein  32.38 
 
 
245 aa  80.5  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.062323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  31.54 
 
 
207 aa  80.9  2e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  32.24 
 
 
207 aa  79.7  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  35.02 
 
 
236 aa  79.3  5e-14  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  34.14 
 
 
454 aa  79.3  6e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  30.6 
 
 
236 aa  78.6  1e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  34.91 
 
 
229 aa  77.4  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3142  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  36.63 
 
 
240 aa  78.2  2e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  33.1 
 
 
240 aa  77  3e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  33.33 
 
 
449 aa  76.3  5e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.47 
 
 
234 aa  76.3  5e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  31.41 
 
 
241 aa  76.3  6e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  30.71 
 
 
251 aa  75.9  6e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  33.49 
 
 
230 aa  75.9  7e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  33.49 
 
 
230 aa  75.9  7e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  32.7 
 
 
255 aa  75.5  8e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  33.74 
 
 
449 aa  75.1  1e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30.69 
 
 
225 aa  73.9  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  34.12 
 
 
245 aa  72.8  5e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  30.38 
 
 
206 aa  73.2  5e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  34.22 
 
 
228 aa  72.4  7e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  33.2 
 
 
997 aa  71.6  1e-11  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  30.88 
 
 
228 aa  72  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  30.65 
 
 
238 aa  71.6  1e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>