More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5439 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 414 aa  836    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  56.73 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  53.82 
 
 		 374 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  46.83 
 
 		 374 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1667  protein of unknown function DUF323  54.17 
 
 		 374 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0550872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  40.69 
 
 		 444 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  39.02 
 
 		 447 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  37.66 
 
 		 437 aa  236  7e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  38.01 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  32.22 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  37.05 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  37.06 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  36.22 
 
 		 446 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  35.32 
 
 		 819 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  36.36 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  36.69 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  39.38 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  39.38 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  39.38 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  37.24 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  34.93 
 
 		 506 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  36.5 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  35.28 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  39.27 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.59 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  34.81 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  40.47 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  37.87 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  35.32 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  34.13 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  38.48 
 
 		 448 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  33.58 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  37.08 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  30.95 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  31.04 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  32.43 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  35.31 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  28.04 
 
 		 416 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.79 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  33.92 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  35.71 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  32.81 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  34.45 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  33.86 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2565  hypothetical protein  36.51 
 
 		 418 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  33.92 
 
 		 434 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  33.33 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  31.97 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  29.18 
 
 		 766 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  31.53 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  31.06 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  33.08 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  29.41 
 
 		 432 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  31.66 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0822  protein of unknown function DUF323  30.85 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  31.88 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  31.09 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  34.11 
 
 		 453 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  31.39 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  32.13 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  31.35 
 
 		 425 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  32.82 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  33.86 
 
 		 453 aa  142  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  31.51 
 
 		 432 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  31.7 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  31.73 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  31.01 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  28.72 
 
 		 383 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  30.98 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  30.49 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  30.83 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  31.25 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  31.77 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  30.65 
 
 		 430 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  31.35 
 
 		 430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  28.89 
 
 		 385 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0918  hypothetical protein  34.08 
 
 		 418 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  32.49 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  28.98 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  28.5 
 
 		 425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  29.65 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  32.91 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  26.49 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  30.99 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  32.17 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1575  protein of unknown function DUF323  30.53 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  30.31 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  29.75 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  26.46 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  33.67 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  33.67 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  33.55 
 
 		 723 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  30.46 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  32.1 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  31.36 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  28.14 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  33.42 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  29.64 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>