164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4957 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4957  porin  100 
 
 		 302 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  63.92 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  63.92 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  57.81 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  57.01 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  56.37 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  56.37 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  57.53 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  57.53 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  57.69 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  54.72 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  57.69 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  57.69 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  55.56 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  54.23 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  56.55 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  55.21 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  56.6 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  52.77 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  52.1 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  55.13 
 
 		 294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  54.72 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  53.09 
 
 		 278 aa  228  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  52.56 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  53.12 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  54.71 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  53.65 
 
 		 288 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  45.9 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  50.16 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  52.52 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  43.75 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  41.38 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  40.19 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  40.19 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  39.25 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  38.94 
 
 		 285 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  39.49 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  37.12 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  38.63 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2142  porin  36.12 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  38.49 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  35.02 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  33.88 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  34.77 
 
 		 583 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  33.02 
 
 		 571 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  33.07 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  33.88 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  40.98 
 
 		 243 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  30.55 
 
 		 244 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  34.3 
 
 		 453 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.07 
 
 		 240 aa  89.4  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  30.39 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  41.1 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  35.11 
 
 		 245 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  27.93 
 
 		 255 aa  85.9  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  30.82 
 
 		 207 aa  85.5  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2341  porin  36.15 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608955  normal  0.297853 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  29.77 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  34.92 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.39 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  31.43 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  30.56 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  36.36 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  34.33 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  27.36 
 
 		 570 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  26.98 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  31.1 
 
 		 997 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  31.15 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  29.62 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  34.48 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.87 
 
 		 206 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  30.35 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1282  putative outer membrane protein  27.17 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494917  normal  0.183567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  30 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0873  porin  35.36 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  29.13 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  27.83 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2735  hypothetical protein  29.45 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  27.59 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1729  putative outer membrane protein precursor  27.08 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.259515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1178  outer membrane protein  26.97 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.557551  normal  0.0838188 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  30 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  33.05 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  27.1 
 
 		 566 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7453  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  32.62 
 
 		 710 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0722321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3428  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  34.36 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  30.49 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  31.2 
 
 		 693 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3164  porin  36.29 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.99 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4375  putative outer-membrane protein  35.32 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.434769  normal  0.0632497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  29.62 
 
 		 229 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  29.26 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  29.26 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  29.71 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  31.31 
 
 		 449 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  28.21 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1363  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.94 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76499  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0423  carbohydrate-selective porin OprB  27.53 
 
 		 692 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  28.77 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>