173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1614 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  89.31 
 
 
283 aa  446  1e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  88.55 
 
 
271 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  64.88 
 
 
255 aa  316  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  64.61 
 
 
252 aa  296  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  61.89 
 
 
252 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  57.09 
 
 
265 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  57.2 
 
 
261 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  57.85 
 
 
265 aa  255  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  54.94 
 
 
261 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  58.33 
 
 
257 aa  254  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  53.44 
 
 
647 aa  254  1e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  53.85 
 
 
263 aa  253  2e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  57.85 
 
 
257 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  59.5 
 
 
264 aa  252  5e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  52.23 
 
 
259 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  52.23 
 
 
257 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  55.87 
 
 
258 aa  242  4e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  49.26 
 
 
277 aa  232  4e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  51.01 
 
 
274 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  48.21 
 
 
272 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  50 
 
 
269 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  47.03 
 
 
259 aa  222  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  52.56 
 
 
290 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  48.86 
 
 
254 aa  215  6e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  50.83 
 
 
248 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  47.08 
 
 
272 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  47.56 
 
 
264 aa  205  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  47.5 
 
 
249 aa  195  5e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  48.93 
 
 
248 aa  195  5e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  43.78 
 
 
256 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  49.79 
 
 
252 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  45.73 
 
 
251 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  44.17 
 
 
247 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  46.67 
 
 
249 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  46.44 
 
 
244 aa  168  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  41.27 
 
 
254 aa  164  1e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  34 
 
 
257 aa  159  5e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  42.08 
 
 
248 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  34.62 
 
 
253 aa  154  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  30.49 
 
 
260 aa  151  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  35.02 
 
 
279 aa  142  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  34.18 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  34.18 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  1.40392e-07  hitchhiker  9.02529e-10 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.75 
 
 
254 aa  64.7  1e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  27.83 
 
 
274 aa  62.4  7e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.94 
 
 
261 aa  57.8  2e-07  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  28.8 
 
 
258 aa  57  3e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0986  hypothetical protein  34.55 
 
 
218 aa  56.2  5e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.749741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  42.17 
 
 
308 aa  54.7  1e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
256 aa  54.3  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 
294 aa  53.5  3e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
275 aa  50.4  3e-05  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
311 aa  50.4  3e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.38 
 
 
374 aa  50.4  3e-05  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  27.71 
 
 
237 aa  50.1  4e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  25.65 
 
 
255 aa  50.1  4e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  34.62 
 
 
260 aa  49.7  4e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  3.26151e-06  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
273 aa  49.3  6e-05  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0212  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  23.76 
 
 
257 aa  49.3  7e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
266 aa  48.9  8e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.43 
 
 
259 aa  48.9  8e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.62 
 
 
370 aa  48.9  8e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.11 
 
 
397 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.94 
 
 
371 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
266 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  27.4 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
280 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  28.05 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  35.11 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4392  putative dioxygenase  34.12 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.537049  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3950  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0198056  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  36.73 
 
 
300 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  24.35 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.78 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
274 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  42.27 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  30.53 
 
 
264 aa  45.4  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  30.8 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
311 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  44.58 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5487  hypothetical protein  33.68 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.324647  normal  0.336952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>