62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0057 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0246  radical SAM domain-containing protein  90.46 
 
 		 367 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0057  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 367 aa  743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615692  normal  0.0888986 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5394  Radical SAM domain protein  93.46 
 
 		 367 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  73.18 
 
 		 359 aa  545  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  73.31 
 
 		 360 aa  547  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4562  radical SAM domain-containing protein  72.27 
 
 		 360 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343645  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1409  hypothetical protein  71.27 
 
 		 356 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2714  Radical SAM domain protein  70.79 
 
 		 356 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2103  radical SAM domain-containing protein  70.83 
 
 		 362 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.938739  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7577  Biotin synthase-related enzyme  76.73 
 
 		 323 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  71.27 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2620  Radical SAM domain protein  64.44 
 
 		 371 aa  472  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0838  Elongator protein 3/MiaB/NifB  58.54 
 
 		 365 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.195743  normal  0.168484 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1109  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.82 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13141  hypothetical protein  51.96 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4750  Radical SAM domain protein  58.38 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2060  Radical SAM domain protein  48.19 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6661  radical SAM domain-containing protein  50.78 
 
 		 337 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000604358  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4690  Radical SAM domain protein  48.96 
 
 		 351 aa  268  8.999999999999999e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1221  radical SAM domain-containing protein  48.78 
 
 		 356 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0196  hypothetical protein  26.95 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2747  hypothetical protein  27.96 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2885  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806461  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0775  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2140  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0963  hypothetical protein  26.27 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0270  hypothetical protein  25.71 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.901692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1508  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2001  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1164  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0394  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1803  radical SAM family protein  30.57 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2204  radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1052  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1034  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0445  radical SAM family protein  32.71 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2197  radical SAM family protein  23.57 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804971  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  22.94 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6000  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0644  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 390 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.14053  normal  0.0928811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1662  radical SAM family Fe-S protein  24.8 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2171  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00159358  decreased coverage  0.000000000651126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2543  radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2046  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 331 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  29.14 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  32.12 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  29.77 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.16 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0033  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.531209  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  25.4 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0919  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000116556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  26.4 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  23.64 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1558  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0417812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  24.6 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  31.65 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2088  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0962  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  28.12 
 
 		 368 aa  43.1  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  30.16 
 
 		 347 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>