More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1548 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 129 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  43.1 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  43.97 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  45.13 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.94 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  40.68 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  40.68 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  44.35 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  45.31 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  45.97 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  44.44 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  42.28 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  51.96 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  43.08 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  49.52 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  42.61 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  41.3 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.98 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  42.11 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  41.46 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.15 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.67 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  42.86 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  39.47 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.82 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  39.66 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.1 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.93 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  46 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.35 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  41.07 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  39.68 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  43.9 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  52 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.83 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  34.15 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  44.12 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  38.66 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  41.41 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>