239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1189 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
186 aa  384  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  46.49 
 
 
189 aa  194  5e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  47.67 
 
 
184 aa  175  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.92 
 
 
215 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  41.62 
 
 
185 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.3 
 
 
193 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
186 aa  145  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  39.34 
 
 
186 aa  145  4e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  37.77 
 
 
216 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  7.09652e-06 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.46 
 
 
186 aa  137  8e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.08 
 
 
194 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.71 
 
 
185 aa  118  5e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  40.28 
 
 
165 aa  116  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.51 
 
 
192 aa  109  2e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  34.03 
 
 
188 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
191 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.98 
 
 
189 aa  105  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  31.89 
 
 
188 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  30.32 
 
 
189 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
200 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  5.00824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  32.29 
 
 
189 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.94 
 
 
190 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.84 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.53 
 
 
190 aa  97.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.05 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.23527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  30.32 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  29.84 
 
 
190 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  29.69 
 
 
189 aa  94.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.81 
 
 
190 aa  91.7  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.48 
 
 
195 aa  87.8  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  28.65 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.49 
 
 
186 aa  84.3  1e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  4.89831e-08 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
192 aa  84  1e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 
195 aa  82.8  2e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.61 
 
 
200 aa  83.6  2e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  31.98 
 
 
192 aa  82.4  3e-15  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  31.98 
 
 
192 aa  82.4  3e-15  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  29.51 
 
 
195 aa  80.9  1e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.41 
 
 
160 aa  77  1e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  30.53 
 
 
189 aa  76.3  2e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  30.61 
 
 
194 aa  75.5  4e-13  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.37 
 
 
197 aa  73.6  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  27.96 
 
 
187 aa  72  5e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  30.71 
 
 
177 aa  67.8  1e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  25.31 
 
 
183 aa  65.9  3e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.7 
 
 
189 aa  65.9  4e-10  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.95 
 
 
199 aa  64.7  7e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  27.75 
 
 
209 aa  63.9  1e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
185 aa  63.2  2e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.16 
 
 
180 aa  62  4e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.2 
 
 
176 aa  62.4  4e-09  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  26.32 
 
 
177 aa  61.6  5e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  24.82 
 
 
178 aa  61.2  8e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  26.83 
 
 
164 aa  60.8  1e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  27.54 
 
 
184 aa  60.8  1e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  4.40007e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.76 
 
 
186 aa  60.5  1e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  29.23 
 
 
195 aa  60.8  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.23 
 
 
194 aa  59.7  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  27.66 
 
 
208 aa  60.1  2e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  24.43 
 
 
187 aa  59.7  2e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  3.03002e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  26.9 
 
 
202 aa  59.3  3e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.07 
 
 
180 aa  58.9  4e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  27.97 
 
 
186 aa  58.9  4e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  24.32 
 
 
188 aa  59.3  4e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  29.93 
 
 
185 aa  57.8  8e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  25.52 
 
 
205 aa  57.8  8e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  27.34 
 
 
162 aa  57.8  9e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  28.1 
 
 
167 aa  57.8  9e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  27.32 
 
 
209 aa  57.8  1e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  27.4 
 
 
168 aa  57.4  1e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  24.82 
 
 
178 aa  57.4  1e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  28.68 
 
 
185 aa  57.4  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  29.7 
 
 
207 aa  56.6  2e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  27.89 
 
 
228 aa  56.6  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
182 aa  56.2  2e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25 
 
 
207 aa  56.6  2e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.8 
 
 
209 aa  55.8  3e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.72 
 
 
176 aa  55.8  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  26.59 
 
 
205 aa  55.8  4e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.03 
 
 
168 aa  55.5  4e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.29 
 
 
215 aa  55.5  5e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  27.34 
 
 
180 aa  55.5  5e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  26.01 
 
 
205 aa  54.7  8e-07  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  28.06 
 
 
169 aa  54.7  8e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  26.14 
 
 
194 aa  54.3  9e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1226  flavin reductase domain-containing protein  26.71 
 
 
248 aa  53.9  1e-06  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.384707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.56 
 
 
196 aa  53.9  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  25.42 
 
 
207 aa  54.3  1e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  25.73 
 
 
218 aa  53.9  1e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 
180 aa  54.3  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  24.86 
 
 
207 aa  54.3  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  26.87 
 
 
204 aa  54.3  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  25.93 
 
 
208 aa  53.9  1e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
169 aa  53.5  2e-06  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  1.43727e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  25 
 
 
205 aa  53.1  2e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  27.65 
 
 
206 aa  53.1  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  26.12 
 
 
180 aa  53.5  2e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  25.81 
 
 
207 aa  52.4  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  25.84 
 
 
210 aa  52.8  3e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>