More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0313 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 384 aa  792    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  59.38 
 
 		 384 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  58.85 
 
 		 383 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  50.41 
 
 		 388 aa  358  9e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  48.83 
 
 		 374 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.81 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  39.8 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.31 
 
 		 393 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.25 
 
 		 400 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.32 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  36.9 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  35.62 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  33.91 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34 
 
 		 400 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.5 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.95 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  36.78 
 
 		 396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  36.47 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  34.84 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  33.17 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  34.94 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  34.18 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  32.36 
 
 		 401 aa  190  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  31.46 
 
 		 411 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  30.52 
 
 		 392 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  32.18 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  33.09 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.98 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  31.87 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  30.33 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 		 411 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 393 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 391 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.92 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  32.04 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  29.85 
 
 		 393 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 		 854 aa  155  1e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.87 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.87 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.93 
 
 		 357 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.45 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.75 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  31.88 
 
 		 402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.52 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  32.15 
 
 		 402 aa  146  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.94 
 
 		 357 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.54 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30.12 
 
 		 361 aa  145  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.08 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  30.12 
 
 		 361 aa  143  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.27 
 
 		 355 aa  142  8e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.27 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.09 
 
 		 359 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 		 785 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.81 
 
 		 392 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.7 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  32.56 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  31.52 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  29.82 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.65 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  30.38 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.1 
 
 		 784 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  31.1 
 
 		 784 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  31.1 
 
 		 784 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  40.17 
 
 		 248 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  30.81 
 
 		 784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.81 
 
 		 784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  30.81 
 
 		 784 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  28.4 
 
 		 832 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.97 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.43 
 
 		 784 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  30.52 
 
 		 784 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  39.74 
 
 		 245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  27.97 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.78 
 
 		 827 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1293  Nucleotidyl transferase  30.56 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.327446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.36 
 
 		 784 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.36 
 
 		 784 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 828 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.29 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  29.5 
 
 		 841 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.68 
 
 		 356 aa  127  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  27.59 
 
 		 830 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 370 aa  125  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  25.82 
 
 		 832 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.72 
 
 		 830 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.02 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.92 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 776 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  27.25 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.75 
 
 		 820 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.61 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>