146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2142 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2142  porin  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.358073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2428  porin  76.72 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799812  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2972  porin  59.72 
 
 		 285 aa  301  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2745  porin  59.38 
 
 		 285 aa  298  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2867  porin  61.65 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3848  porin  60.15 
 
 		 287 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0125  porin  46.49 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5086  porin  46.88 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62657  normal  0.99686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5028  porin  46.85 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654238  normal  0.049005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4568  porin  46.85 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170806  normal  0.117161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4957  porin  38.46 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4907  porin  41.21 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4443  porin  41.21 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.877928  normal  0.484649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5256  porin  43.61 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4191  porin  46.21 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1340  porin  43.77 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1182  porin  43.77 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.0724335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3292  porin  43.85 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3005  porin  43.63 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3108  porin  43.95 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0475237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2882  porin  43.95 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5409  porin  44.98 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0474  porin  36.81 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3321  porin  44.22 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4247  porin  46.18 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.740101  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1001  porin  41.64 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221202  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1292  porin  43.33 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0513  porin  39.35 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.263575  hitchhiker  0.00240622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1286  porin  41.84 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4355  porin  43.91 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.64859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3986  porin  43.91 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0565804  normal  0.846216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4335  porin  44.76 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.274353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1624  porin  41.84 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4466  porin  43.27 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.927137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1415  porin  41.7 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118187 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7000  hypothetical protein  38.43 
 
 		 583 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.000000122606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7845  porin  42.16 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190915  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6124  porin  41.55 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2044  porin  41.03 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3379  porin  39.42 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3299  porin  38.6 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.466189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6698  porin  36.99 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  30.14 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1770  putative outer membrane protein  34.55 
 
 		 571 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  30.14 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2146  porin  31.68 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2469  porin  30.85 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  decreased coverage  0.00325147 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0108  porin  29.62 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.243352  normal  0.0665959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1941  outer membrane protein  30.29 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0239  putative outer membrane protein  30.66 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4777  porin  36.62 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5167  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.58 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0118  outer membrane protein, putative  26.79 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0115  putative outer membrane protein  26.79 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2467  porin  31.2 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2468  porin  31.45 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0132  porin  29.14 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0889  porin  29.76 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115506 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  27.12 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3546  porin  36.61 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  31.03 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6126  putative outer membrane protein  32.05 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2780  hypothetical protein  28.01 
 
 		 570 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  32.2 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3234  putative outer membrane protein  28.52 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  27.4 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0836  porin  37.05 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0404918  normal  0.853535 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0188  outer membrane protein  28.88 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0566764  normal  0.419379 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0748  putative outer membrane protein  32.08 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0795  putative outer membrane protein  33.07 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3853  porin  29.02 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3103  OmpA-like transmembrane region  29.43 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.309907  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  28.73 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3232  OmpA domain-containing protein  29.2 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000209958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2199  putative outer membrane protein  26.41 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4826  OmpA-like transmembrane region  27.56 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0925  porin  29.01 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.743956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  27.13 
 
 		 228 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  26.56 
 
 		 228 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  25.39 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  36.81 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0244  outer membrane protein  26.32 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0278  OmpA-like transmembrane region  28.03 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.670906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2294  porin  31.62 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0475  porin  28.82 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556645  normal  0.835122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0841  putative outer membrane protein  26.95 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0096  outer membrane protein, 31 kDa  28.63 
 
 		 237 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  25 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2343  porin  31.82 
 
 		 207 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4560  outer membrane protein  27.38 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.400354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0900  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.09 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.801875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5301  hypothetical protein  28.47 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0888  porin  28.37 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0164958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7274  hypothetical protein  27.97 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3175  hypothetical protein  25.84 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4615  outer membrane protein  30.1 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4523  putative outer-membrane protein precursor  25.26 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2527  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  29.37 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.442194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3147  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  28.25 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0657581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  32.35 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>